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Domik,  Dajana

Elucidation of a gene cluster involved in the biosynthesis of the volatile metabolite sodorifen emitted by Serratia plymuthica 4Rx13

Rostock : Universität , 2016

https://doi.org/10.18453/rosdok_id00001712

http://purl.uni-rostock.de/rosdok/id00001712

Abstract:

The objective of this work was the elucidation of the biosynthesis of the secondary metabolite sodorifen, which is emitted by the bacterium Serratia plymuthica 4Rx13. Therefore, the genome and transcriptome data of the producer isolate 4Rx13 and the non-producer isolate AS9 were analyzed. The combination of genome and transcriptome data led to a list of potential candidate genes, which were checked for their functional involvement into the biosynthesis of sodorifen by mutagenesis. Consequently, a cluster of four genes was located and further investigated.

Dissertation Open Access


Einrichtung :
Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät
Gutachter :
Piechulla,  Birgit  (Prof. Dr.)
Schulz,  Stefan  (Prof. Dr.)
Jahr der Abgabe:
2015
Jahr der Verteidigung:
2016
Sprache(n) :
Englisch
übersetzter Titel :
Aufklärung des Genclusters für die Biosynthese des flüchtigen Sekundärmetabolit Sodorifen, welches durch Serratia plymuthca 4Rx13 emittiert wird
übersetzte Zusammenfassung :
Das Ziel dieser Arbeit war die Aufklärung der Biosynthese des Sekundärmetaboliten Sodorifen, das vom Bakterium Serratia plymuthica 4Rx13 abgegeben wird. Für die Untersuchung wurde das Genom und das Transkriptom des Sodorifen-Produzenten Isolat 4Rx13 mit dem Nicht-Produzenten Isolat AS9 verglichen. Mittels vergleichender Analyse konnte eine Liste von Kandidatengenen erstellt werden. Diese wurden hinsichtlich ihrer Funktion bei der Sodorifenbiosynthese durch Mutagenese überprüft. Letztendlich konnte so ein Cluster, bestehend aus vier Genen, ausfindig gemacht und detaillierter untersucht werden.
Schlagworte:
Bacteria, Transcriptome, Genome
DDC Klassifikation :
570 Biowissenschaften, Biologie
URN :
urn:nbn:de:gbv:28-diss2016-0025-6
Persistente URL:
http://purl.uni-rostock.de/rosdok/id00001712
erstellt am:
2016-04-13
zuletzt geändert am:
2018-06-30
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