mycoreobjectrosdok_disshab_0000001264rosdok_disshab_0000001264rosdokdisshabrosdok_derivate_00000219092023-08-08T10:05:27.601Z2014-11-28T14:15:45.834ZadministratoreditorDpublished1rosdok_derivate_0000021909truetruederivate_types:fulltextVolltextfulltextwf_edit_epub wf_register_epubstate:publishedstate:publishedveröffentlichtpublishedrosdok/id00001443815216483MODS updated during RosDok migration in June 2021DissertationHochschulschrift1062851285NinaMelzer1982-VerfasserInautInvestigating possibilities to predict milk phenotypes in Holstein Friesian cows based on a more complex model of the genotype-phenotype mapUntersuchung von Möglichkeiten zur Vorhersage von Milchmerkmalen von Holstein Friesian Kühen basierend auf einem komplexeren Modell der Genotyp-Phänotyp-Abbildungen133515931Prof. Dr.OlafWolkenhauerUniversität Rostock, Lehrstuhl für Systembiologie und Bioinformatik, Institut für Informatik und ElektrotechnikAkademischeR BetreuerIndgsDr.DirkRepsilberLeibniz-Institut für Nutztierbiologie, Institut für Genetik und Biometrie, Abteilung Bioinformatik und BiomathematikAkademischeR BetreuerIndgsProf. Dr.ThomasMartinetzUniversität zu Lübeck, Sektion Informatik / Technik, Institut für Neuro- und BioinformatikAkademischeR BetreuerIndgs10085032-7Universität RostockFakultät für Informatik und ElektrotechnikGrad-verleihende Institutiondgg10.18453/rosdok_id00001443http://purl.uni-rostock.de/rosdok/id00001443urn:nbn:de:gbv:28-diss2014-0195-4000 Allgemeines, Wissenschaft570 Biowissenschaften, BiologieFakultät für Informatik und Elektrotechnikfrei zugänglich (Open Access)Lizenz Metadaten: CC0Nutzungsrechte erteiltalle Rechte vorbehaltenUniversität RostockRostock2014monographic20142014Universitätsbibliothek RostockRostock20142014The prediction of genetic values based on genomic and phenotypic information plays an important role in dairy cattle breeding. This thesis investigates if an improved prediction can be obtained when in addition the metabolome is considered. Data for the three system-levels were (a) simulated using a systems biology approach and (b) experimentally collected (~1300 cows). An integrative bioinformatics approach for data analysis was developed. Concluding, the metabolome provides a deeper insight into the relationships between different levels, whose exploitation can lead to improved prediction.In der Rinderzucht ist die Vorhersage von genetischen Werten beruhend auf Genotyp- und Phänotypinformationen von zentraler Bedeutung. Die Arbeit untersucht, ob diese verbessert werden kann, wenn zusätzlich das Metabolom betrachtet wird. Die Daten der drei Ebenen wurden (a) mittels systembiologischen Ansatzes simuliert und (b) experimentell (~1300 Kühe) erhoben. Für die Datenauswertung wurde ein integrativ bioinformatischer Ansatz entwickelt. Das Metabolom erlaubt tiefergehende Untersuchungen der Beziehung zwischen den Ebenen, deren Nutzung wiederum zu einer verbesserten Vorhersage führen kann.milk metaboliteSNPgenetic value predictionintegrative bioinformatics approachsimulationUniversitätsbibliothek Rostockhttp://purl.uni-rostock.de/rosdok/id00001443doctype:epubdoctype:epubDokumenttypDocument typedoctype:epub.dissertationdoctype:epub.dissertationDissertationdoctoral thesisdiniPublType:doctoralThesis diniPublType2022:PhDThesis XMetaDissPlusThesisLevel:thesis.doctoralinfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisdocumentnatureOfContent:ppn_105825778natureOfContent:ppn_105825778HochschulschriftdiniPublType2022:DoctoralThesisdiniPublType2022:DoctoralThesisDissertation oder HabilitationDoctoral thesisDRIVERdiniPublType2022:PhDThesisdiniPublType2022:PhDThesisDissertationPhD thesisKDSF (Pu34)XMetaDissPlusThesisLevel:thesis.doctoralXMetaDissPlusThesisLevel:thesis.doctoralDoktorarbeitdoctoral thesisrfc5646:enrfc5646:enEnglischEnglishengengSDNB:000SDNB:000000 Allgemeines, Wissenschaft000 Generalities, ScienceSDNB:570SDNB:570570 Biowissenschaften, Biologie570 Life scienceinstitution:unirostockinstitution:unirostockUniversität RostockUniversity of RostockUniversität RostockUniversität RostockUni.Rostockhttp://d-nb.info/gnd/38329-6institution:unirostock.iefinstitution:unirostock.iefFakultät für Informatik und ElektrotechnikFaculty of Computer Science and Electrical EngineeringUniversität Rostock. Fakultät für Informatik und ElektrotechnikFakultät für Informatik<br />und ElektrotechnikUni.Rostock.Fakultaet.IEFhttp://d-nb.info/gnd/10085032-7accesscondition:openaccessaccesscondition:openaccessfrei zugänglich (Open Access)open accesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2OAfreeinfo:eu-repo/semantics/openAccess[DE-28]Open Access$gControlled Vocabulary for Access Rights$uhttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2licenseinfo:metadatalicenseinfo:metadataLizenzen für Metadatenlicenseinfo:metadata.cc0licenseinfo:metadata.cc0Lizenz Metadaten: CC0license metadata: CC0/creativecommons/p/zero/1.0/88x31.pnghttps://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/licenseinfo:depositlicenseinfo:depositVeröffentlichungsgenehmigungpermission to storelicenseinfo:deposit.rightsgrantedlicenseinfo:deposit.rightsgrantedNutzungsrechte erteiltrights grantedlicenseinfo:worklicenseinfo:workWerkworklicenseinfo:work.rightsreservedlicenseinfo:work.rightsreservedalle Rechte vorbehaltenall rights reserved/creativecommons/r/reserved/0.9/88x31.png[DE-28]Urheberrechtsschutz 1.0$gRights Statements$uhttp://rightsstatements.org/vocab/InC/1.0/http://rightsstatements.org/vocab/InC/1.0/http://rightsstatements.org/vocab/InC/1.0/Investigating possibilities to predict milk phenotypes in Holstein Friesian cows based on a more complex model of the genotype-phenotype mapUntersuchung von Möglichkeiten zur Vorhersage von Milchmerkmalen von Holstein Friesian Kühen basierend auf einem komplexeren Modell der Genotyp-Phänotyp-AbbildungInvestigating possibilities to predict milk phenotypes in Holstein Friesian cows based on a more complex model of the genotype-phenotype mapgnd:1062851285gnd:133515931gnd:10085032-7gnd:1062851285gnd:133515931gnd:10085032-7rosdok_disshab_0000001264-d1302602e39gnd:1062851285Nina MelzerNina Melzerrosdok_disshab_0000001264-d1302602e62gnd:133515931Prof. Dr. Olaf WolkenhauerProf. Dr. Olaf Wolkenhauerrosdok_disshab_0000001264-d1302602e77Dr. Dirk RepsilberDr. Dirk Repsilberrosdok_disshab_0000001264-d1302602e91Prof. Dr. Thomas MartinetzProf. Dr. Thomas Martinetzrosdok_disshab_0000001264-d1302602e104gnd:10085032-7Universität Rostock Fakultät für Informatik und ElektrotechnikUniversität Rostock Fakultät für Informatik und ElektrotechnikNina MelzerProf. Dr. Olaf WolkenhauerDr. Dirk RepsilberProf. Dr. Thomas MartinetzUniversität Rostock Fakultät für Informatik und ElektrotechnikNina MelzerProf. Dr. Olaf WolkenhauerDr. Dirk RepsilberProf. Dr. Thomas MartinetzUniversität Rostock Fakultät für Informatik und ElektrotechnikNina MelzerRostockUniversität Rostockepub.dissertation10.18453/rosdok_id00001443http://purl.uni-rostock.de/rosdok/id00001443urn:nbn:de:gbv:28-diss2014-0195-4milk metaboliteSNPgenetic value predictionintegrative bioinformatics approachsimulationThe prediction of genetic values based on genomic and phenotypic information plays an important role in dairy cattle breeding. This thesis investigates if an improved prediction can be obtained when in addition the metabolome is considered. Data for the three system-levels were (a) simulated using a systems biology approach and (b) experimentally collected (~1300 cows). An integrative bioinformatics approach for data analysis was developed. Concluding, the metabolome provides a deeper insight into the relationships between different levels, whose exploitation can lead to improved prediction.In der Rinderzucht ist die Vorhersage von genetischen Werten beruhend auf Genotyp- und Phänotypinformationen von zentraler Bedeutung. Die Arbeit untersucht, ob diese verbessert werden kann, wenn zusätzlich das Metabolom betrachtet wird. Die Daten der drei Ebenen wurden (a) mittels systembiologischen Ansatzes simuliert und (b) experimentell (~1300 Kühe) erhoben. Für die Datenauswertung wurde ein integrativ bioinformatischer Ansatz entwickelt. Das Metabolom erlaubt tiefergehende Untersuchungen der Beziehung zwischen den Ebenen, deren Nutzung wiederum zu einer verbesserten Vorhersage führen kann.20142014epub.dissertation1 Dissertation_Melzer_2014.pdf 17886636 078ef554e8b3d59f843da6585e604aec rosdok/id00001443815216483MODS updated during RosDok migration in June 2021DissertationHochschulschrift1062851285NinaMelzer1982-VerfasserInautInvestigating possibilities to predict milk phenotypes in Holstein Friesian cows based on a more complex model of the genotype-phenotype mapUntersuchung von Möglichkeiten zur Vorhersage von Milchmerkmalen von Holstein Friesian Kühen basierend auf einem komplexeren Modell der Genotyp-Phänotyp-Abbildungen133515931Prof. Dr.OlafWolkenhauerUniversität Rostock, Lehrstuhl für Systembiologie und Bioinformatik, Institut für Informatik und ElektrotechnikAkademischeR BetreuerIndgsDr.DirkRepsilberLeibniz-Institut für Nutztierbiologie, Institut für Genetik und Biometrie, Abteilung Bioinformatik und BiomathematikAkademischeR BetreuerIndgsProf. Dr.ThomasMartinetzUniversität zu Lübeck, Sektion Informatik / Technik, Institut für Neuro- und BioinformatikAkademischeR BetreuerIndgs10085032-7Universität RostockFakultät für Informatik und ElektrotechnikGrad-verleihende Institutiondgg10.18453/rosdok_id00001443http://purl.uni-rostock.de/rosdok/id00001443urn:nbn:de:gbv:28-diss2014-0195-4000 Allgemeines, Wissenschaft570 Biowissenschaften, BiologieFakultät für Informatik und Elektrotechnikfrei zugänglich (Open Access)Lizenz Metadaten: CC0Nutzungsrechte erteiltalle Rechte vorbehaltenUniversität RostockRostock2014monographic20142014Universitätsbibliothek RostockRostock20142014The prediction of genetic values based on genomic and phenotypic information plays an important role in dairy cattle breeding. This thesis investigates if an improved prediction can be obtained when in addition the metabolome is considered. Data for the three system-levels were (a) simulated using a systems biology approach and (b) experimentally collected (~1300 cows). An integrative bioinformatics approach for data analysis was developed. Concluding, the metabolome provides a deeper insight into the relationships between different levels, whose exploitation can lead to improved prediction.In der Rinderzucht ist die Vorhersage von genetischen Werten beruhend auf Genotyp- und Phänotypinformationen von zentraler Bedeutung. Die Arbeit untersucht, ob diese verbessert werden kann, wenn zusätzlich das Metabolom betrachtet wird. Die Daten der drei Ebenen wurden (a) mittels systembiologischen Ansatzes simuliert und (b) experimentell (~1300 Kühe) erhoben. Für die Datenauswertung wurde ein integrativ bioinformatischer Ansatz entwickelt. 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