mycoreobjectrosdok_disshab_0000001570rosdok_disshab_0000001570rosdokdisshabrosdok_derivate_00000347242023-08-08T10:06:59.227Z2016-06-30T07:26:10.200ZadministratoreditorDpublished1rosdok_derivate_0000034724truetruederivate_types:fulltextVolltextfulltextwf_edit_epub wf_register_epubstate:publishedstate:publishedveröffentlichtpublishedrosdok/id00001749862648602MODS updated during RosDok migration in June 2021DissertationHochschulschrift1054537844HenrikRudolf1974-VerfasserInautAnalyzing gene expression data with linear mixed modelsapplications to variable pool sizes and biomarkersen136930824Prof. Dr. rer. nat.ManfredSchwerinUniversität Rostock, Agrar- und Umweltwissenschaftliche FakultätAkademischeR BetreuerIndgs142625108Prof. Dr. agr.NorbertReinschLeibniz-Institut für Nutztierbiologie, Institut für Genetik und BiometrieAkademischeR BetreuerIndgs112811655Prof. Dr. agr.KasparBienefeldHumbold-Universität zu Berlin, Lebenswissenschaftliche FakultätAkademischeR BetreuerIndgs10025954-6Universität RostockAgrar- und Umweltwissenschaftliche FakultätGrad-verleihende Institutiondgg10.18453/rosdok_id00001749http://purl.uni-rostock.de/rosdok/id00001749urn:nbn:de:gbv:28-diss2016-0062-1630 Landwirtschaft, Veterinärmedizin510 MathematikAgrar- und Umweltwissenschaftliche Fakultätfrei zugänglich (Open Access)Lizenz Metadaten: CC0Nutzungsrechte erteiltalle Rechte vorbehaltenUniversität RostockRostock2016monographic20162016Universitätsbibliothek RostockRostock20162016This work is about the design and statistical analysis of gene expression experiments with variable pool sizes. Conditions for unbiased contrasts in such experiments were derived. They were analyzed with linear mixed models, introducing a new type of variance component that accounts for unequal shares of individual samples in common pools. The relevance of this blending error variance was then investigated for four experimental data sets from different species. Finally a biomarker search for hygienic behavior in Apis mellifera workers was conducted, using nerve tissue gene expression data.Diese Arbeit behandelt Fragen der statistischen Planung und Auswertung von Genexpressionsexperimenten mit Mischproben (Pools) und variabler Zahl von individuellen Proben je Pool (Poolgröße). Eine Bedingung für die Verzerrungsfreiheit von Kontrasten im linearen Modell wurde abgeleitet. Die Relevanz der zur Auswertung mit gemischten linearen Modellen eingeführten Mischungsvarianz zeigte sich auch in experimentellen Daten. Eine Biomarkersuche für das individuelle Hygieneverhalten von Arbeiterinnen der Honigbiene leistet einen methodischen Beitrag zur Zucht von Varroa-resistenten Bienenvölkern.pooled samplesblending error variancehygienic behaviorexperimental designvariance componentmicroarrayUniversitätsbibliothek Rostockhttp://purl.uni-rostock.de/rosdok/id00001749doctype:epubdoctype:epubDokumenttypDocument typedoctype:epub.dissertationdoctype:epub.dissertationDissertationdoctoral thesisdiniPublType:doctoralThesis diniPublType2022:PhDThesis XMetaDissPlusThesisLevel:thesis.doctoralinfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisdocumentnatureOfContent:ppn_105825778natureOfContent:ppn_105825778HochschulschriftdiniPublType2022:DoctoralThesisdiniPublType2022:DoctoralThesisDissertation oder HabilitationDoctoral thesisDRIVERdiniPublType2022:PhDThesisdiniPublType2022:PhDThesisDissertationPhD thesisKDSF (Pu34)XMetaDissPlusThesisLevel:thesis.doctoralXMetaDissPlusThesisLevel:thesis.doctoralDoktorarbeitdoctoral thesisrfc5646:enrfc5646:enEnglischEnglishengengSDNB:630SDNB:630630 Landwirtschaft, Veterinärmedizin630 Agriculture630 Landwirtschaft,<br/>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;VeterinärmedizinSDNB:510SDNB:510510 Mathematik510 Mathematicsinstitution:unirostockinstitution:unirostockUniversität RostockUniversity of RostockUniversität RostockUniversität RostockUni.Rostockhttp://d-nb.info/gnd/38329-6institution:unirostock.aufinstitution:unirostock.aufFakultät für Agrar, Bau und UmweltFaculty for Agriculture, Civil and Environmental EngineeringUniversität Rostock. Fakultät für Agrar, Bau und UmweltFakultät für Agrar,<br />Bau und UmweltUni.Rostock.Fakultaet.AUFhttp://d-nb.info/gnd/10025954-6accesscondition:openaccessaccesscondition:openaccessfrei zugänglich (Open Access)open accesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2OAfreeinfo:eu-repo/semantics/openAccess[DE-28]Open Access$gControlled Vocabulary for Access Rights$uhttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2licenseinfo:metadatalicenseinfo:metadataLizenzen für Metadatenlicenseinfo:metadata.cc0licenseinfo:metadata.cc0Lizenz Metadaten: CC0license metadata: CC0/creativecommons/p/zero/1.0/88x31.pnghttps://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/licenseinfo:depositlicenseinfo:depositVeröffentlichungsgenehmigungpermission to storelicenseinfo:deposit.rightsgrantedlicenseinfo:deposit.rightsgrantedNutzungsrechte erteiltrights grantedlicenseinfo:worklicenseinfo:workWerkworklicenseinfo:work.rightsreservedlicenseinfo:work.rightsreservedalle Rechte vorbehaltenall rights reserved/creativecommons/r/reserved/0.9/88x31.png[DE-28]Urheberrechtsschutz 1.0$gRights Statements$uhttp://rightsstatements.org/vocab/InC/1.0/http://rightsstatements.org/vocab/InC/1.0/http://rightsstatements.org/vocab/InC/1.0/Analyzing gene expression data with linear mixed modelsapplications to variable pool sizes and biomarkersAnalyzing gene expression data with linear mixed modelsapplications to variable pool sizes and biomarkersgnd:1054537844gnd:136930824gnd:142625108gnd:112811655gnd:10025954-6gnd:1054537844gnd:136930824gnd:142625108gnd:112811655gnd:10025954-6rosdok_disshab_0000001570-d3872400e39gnd:1054537844Henrik RudolfHenrik Rudolfrosdok_disshab_0000001570-d3872400e61gnd:136930824Prof. Dr. rer. nat. Manfred SchwerinProf. Dr. rer. nat. Manfred Schwerinrosdok_disshab_0000001570-d3872400e76gnd:142625108Prof. Dr. agr. Norbert ReinschProf. Dr. agr. Norbert Reinschrosdok_disshab_0000001570-d3872400e91gnd:112811655Prof. Dr. agr. Kaspar BienefeldProf. Dr. agr. Kaspar Bienefeldrosdok_disshab_0000001570-d3872400e107gnd:10025954-6Universität Rostock Agrar- und Umweltwissenschaftliche FakultätUniversität Rostock Agrar- und Umweltwissenschaftliche FakultätHenrik RudolfProf. Dr. rer. nat. Manfred SchwerinProf. Dr. agr. Norbert ReinschProf. Dr. agr. Kaspar BienefeldUniversität Rostock Agrar- und Umweltwissenschaftliche FakultätHenrik RudolfProf. Dr. rer. nat. Manfred SchwerinProf. Dr. agr. Norbert ReinschProf. Dr. agr. Kaspar BienefeldUniversität Rostock Agrar- und Umweltwissenschaftliche FakultätHenrik RudolfRostockUniversität Rostockepub.dissertation10.18453/rosdok_id00001749http://purl.uni-rostock.de/rosdok/id00001749urn:nbn:de:gbv:28-diss2016-0062-1pooled samplesblending error variancehygienic behaviorexperimental designvariance componentmicroarrayThis work is about the design and statistical analysis of gene expression experiments with variable pool sizes. Conditions for unbiased contrasts in such experiments were derived. They were analyzed with linear mixed models, introducing a new type of variance component that accounts for unequal shares of individual samples in common pools. The relevance of this blending error variance was then investigated for four experimental data sets from different species. Finally a biomarker search for hygienic behavior in Apis mellifera workers was conducted, using nerve tissue gene expression data.Diese Arbeit behandelt Fragen der statistischen Planung und Auswertung von Genexpressionsexperimenten mit Mischproben (Pools) und variabler Zahl von individuellen Proben je Pool (Poolgröße). Eine Bedingung für die Verzerrungsfreiheit von Kontrasten im linearen Modell wurde abgeleitet. Die Relevanz der zur Auswertung mit gemischten linearen Modellen eingeführten Mischungsvarianz zeigte sich auch in experimentellen Daten. Eine Biomarkersuche für das individuelle Hygieneverhalten von Arbeiterinnen der Honigbiene leistet einen methodischen Beitrag zur Zucht von Varroa-resistenten Bienenvölkern.20162016epub.dissertation1 Dissertation_Rudolf_2016.pdf 1476526 cea8049678f0a73a770329b776e3d23d rosdok/id00001749862648602MODS updated during RosDok migration in June 2021DissertationHochschulschrift1054537844HenrikRudolf1974-VerfasserInautAnalyzing gene expression data with linear mixed modelsapplications to variable pool sizes and biomarkersen136930824Prof. Dr. rer. nat.ManfredSchwerinUniversität Rostock, Agrar- und Umweltwissenschaftliche FakultätAkademischeR BetreuerIndgs142625108Prof. Dr. agr.NorbertReinschLeibniz-Institut für Nutztierbiologie, Institut für Genetik und BiometrieAkademischeR BetreuerIndgs112811655Prof. Dr. agr.KasparBienefeldHumbold-Universität zu Berlin, Lebenswissenschaftliche FakultätAkademischeR BetreuerIndgs10025954-6Universität RostockAgrar- und Umweltwissenschaftliche FakultätGrad-verleihende Institutiondgg10.18453/rosdok_id00001749http://purl.uni-rostock.de/rosdok/id00001749urn:nbn:de:gbv:28-diss2016-0062-1630 Landwirtschaft, Veterinärmedizin510 MathematikAgrar- und Umweltwissenschaftliche Fakultätfrei zugänglich (Open Access)Lizenz Metadaten: CC0Nutzungsrechte erteiltalle Rechte vorbehaltenUniversität RostockRostock2016monographic20162016Universitätsbibliothek RostockRostock20162016This work is about the design and statistical analysis of gene expression experiments with variable pool sizes. Conditions for unbiased contrasts in such experiments were derived. They were analyzed with linear mixed models, introducing a new type of variance component that accounts for unequal shares of individual samples in common pools. The relevance of this blending error variance was then investigated for four experimental data sets from different species. Finally a biomarker search for hygienic behavior in Apis mellifera workers was conducted, using nerve tissue gene expression data.Diese Arbeit behandelt Fragen der statistischen Planung und Auswertung von Genexpressionsexperimenten mit Mischproben (Pools) und variabler Zahl von individuellen Proben je Pool (Poolgröße). Eine Bedingung für die Verzerrungsfreiheit von Kontrasten im linearen Modell wurde abgeleitet. Die Relevanz der zur Auswertung mit gemischten linearen Modellen eingeführten Mischungsvarianz zeigte sich auch in experimentellen Daten. 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