mycoreobjectrosdok_disshab_0000001974rosdok_disshab_0000001974rosdokdisshabrosdok_derivate_00000573952023-08-08T10:09:21.091Z2018-10-17T07:56:27.956ZadministratoreditorDpublished1rosdok_derivate_0000057395truetruederivate_types:fulltextVolltextfulltextwf_edit_epub wf_register_epubstate:publishedstate:publishedveröffentlichtpublishedrosdok/id000023151032983337Oau2018-10-172023-08-05T19:10:58ZrdaConverted from PICA to MODS using Pica2Mods XSLT Transformer 2.7 [SCM: "0c0e7a3c226a4a0cbcbec39b493c3c5257339ab8" "v2.7" "2023-08-04T00:00:00+0200"] with mode 'DEFAULT'.DissertationHochschulschriftImproving reproducibility and reuse of modelling results in the life sciencesResearch results are complex and include a variety of heterogeneous data. This entails major computational challenges to (i) to manage simulation studies, (ii) to ensure model exchangeability, stability and validity, and (iii) to foster communication between partners. I describe techniques to improve the reproducibility and reuse of modelling results. First, I introduce a method to characterise differences in computational models. Second, I present approaches to obtain shareable and reproducible research results. Altogether, my methods and tools foster exchange and reuse of modelling results.Die verteilte Entwicklung von komplexen Simulationsstudien birgt eine große Zahl an informationstechnischen Herausforderungen: (i) Modelle müssen verwaltet werden; (ii) Reproduzierbarkeit, Stabilität und Gültigkeit von Ergebnissen muss sichergestellt werden; und (iii) die Kommunikation zwischen Partnern muss verbessert werden. Ich stelle Techniken vor, um die Reproduzierbarkeit und Wiederverwendbarkeit von Modellierungsergebnissen zu verbessern. Meine Implementierungen wurden erfolgreich in internationalen Anwendungen integriert und fördern das Teilen von wissenschaftlichen Ergebnissen.MartinScharm1985 -VerfasserInaut11692264340000-0003-4519-7030OlafWolkenhauer1966 -AkademischeR BetreuerIndgs1335159310000-0001-6105-2937InaKochAkademischeR BetreuerIndgsClemens H.Cap1965 -AkademischeR BetreuerIndgs1217171860000-0003-3958-613638329-6Universität Rostock1419 -Grad-verleihende Institutiondgg10085032-7Universität RostockFakultät für Informatik und Elektrotechnik2004 -Grad-verleihende Institutiondgghttp://purl.uni-rostock.de/rosdok/id00002315urn:nbn:de:gbv:28-diss2018-0146-810.18453/rosdok_id00002315004 Informatik570 Biowissenschaften, BiologieFakultät für Informatik und ElektrotechnikCC BY-SA 4.0Nutzungsrechte erteiltLizenz Metadaten: CC0frei zugänglich (Open Access)en2018Universität RostockRostockmonographic201820182018Universitätsbibliothek RostockRostock2018Universitätsbibliothek Rostockhttp://purl.uni-rostock.de/rosdok/id00002315vorgelegt von Martin ScharmST 340WC 7700ReproduzierbarkeitWiederverwendungBiologisches Modelldoctype:epubdoctype:epubDokumenttypDocument typedoctype:epub.dissertationdoctype:epub.dissertationDissertationdoctoral thesisdiniPublType:doctoralThesis diniPublType2022:PhDThesis XMetaDissPlusThesisLevel:thesis.doctoralinfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisdocumentnatureOfContent:ppn_105825778natureOfContent:ppn_105825778HochschulschriftdiniPublType2022:DoctoralThesisdiniPublType2022:DoctoralThesisDissertation oder HabilitationDoctoral thesisDRIVERdiniPublType2022:PhDThesisdiniPublType2022:PhDThesisDissertationPhD thesisKDSF (Pu34)XMetaDissPlusThesisLevel:thesis.doctoralXMetaDissPlusThesisLevel:thesis.doctoralDoktorarbeitdoctoral thesisSDNB:004SDNB:004004 Informatik004 Data processing Computer sciencesSDNB:570SDNB:570570 Biowissenschaften, Biologie570 Life scienceinstitution:unirostockinstitution:unirostockUniversität RostockUniversity of RostockUniversität RostockUniversität RostockUni.Rostockhttp://d-nb.info/gnd/38329-6institution:unirostock.iefinstitution:unirostock.iefFakultät für Informatik und ElektrotechnikFaculty of Computer Science and Electrical EngineeringUniversität Rostock. Fakultät für Informatik und ElektrotechnikFakultät für Informatik<br />und ElektrotechnikUni.Rostock.Fakultaet.IEFhttp://d-nb.info/gnd/10085032-7licenseinfo:worklicenseinfo:workWerkworklicenseinfo:work.cclicenselicenseinfo:work.cclicenseCC-LizenzCC-licenselicenseinfo:work.cclicense.cc-by-salicenseinfo:work.cclicense.cc-by-saCC BY-SACC BY-SAlicenseinfo:work.cclicense.cc-by-sa.v40licenseinfo:work.cclicense.cc-by-sa.v40CC BY-SA 4.0CC BY-SA 4.0/creativecommons/l/by-sa/4.0/88x31.png[DE-28]Namensnennung - Weitergabe unter gleichen Bedingungen 4.0 International$cCC BY-SA 4.0$gCreative Commons$uhttps://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/licenseinfo:depositlicenseinfo:depositVeröffentlichungsgenehmigungpermission to storelicenseinfo:deposit.rightsgrantedlicenseinfo:deposit.rightsgrantedNutzungsrechte erteiltrights grantedlicenseinfo:metadatalicenseinfo:metadataLizenzen für Metadatenlicenseinfo:metadata.cc0licenseinfo:metadata.cc0Lizenz Metadaten: CC0license metadata: CC0/creativecommons/p/zero/1.0/88x31.pnghttps://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/accesscondition:openaccessaccesscondition:openaccessfrei zugänglich (Open Access)open accesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2OAfreeinfo:eu-repo/semantics/openAccess[DE-28]Open Access$gControlled Vocabulary for Access Rights$uhttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2rfc5646:enrfc5646:enEnglischEnglishengengImproving reproducibility and reuse of modelling results in the life sciencesImproving reproducibility and reuse of modelling results in the life sciencesgnd:1169226434orcid:0000-0003-4519-7030gnd:133515931orcid:0000-0001-6105-2937gnd:121717186orcid:0000-0003-3958-6136gnd:38329-6gnd:10085032-7gnd:1169226434orcid:0000-0003-4519-7030gnd:133515931orcid:0000-0001-6105-2937gnd:121717186orcid:0000-0003-3958-6136gnd:38329-6gnd:10085032-7rosdok_disshab_0000001974-d571753e54gnd:1169226434orcid:0000-0003-4519-7030Martin ScharmMartin Scharmrosdok_disshab_0000001974-d571753e70gnd:133515931orcid:0000-0001-6105-2937Olaf WolkenhauerOlaf Wolkenhauerrosdok_disshab_0000001974-d571753e86Ina KochIna Kochrosdok_disshab_0000001974-d571753e97gnd:121717186orcid:0000-0003-3958-6136Clemens H. 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This entails major computational challenges to (i) to manage simulation studies, (ii) to ensure model exchangeability, stability and validity, and (iii) to foster communication between partners. I describe techniques to improve the reproducibility and reuse of modelling results. First, I introduce a method to characterise differences in computational models. Second, I present approaches to obtain shareable and reproducible research results. Altogether, my methods and tools foster exchange and reuse of modelling results.Die verteilte Entwicklung von komplexen Simulationsstudien birgt eine große Zahl an informationstechnischen Herausforderungen: (i) Modelle müssen verwaltet werden; (ii) Reproduzierbarkeit, Stabilität und Gültigkeit von Ergebnissen muss sichergestellt werden; und (iii) die Kommunikation zwischen Partnern muss verbessert werden. Ich stelle Techniken vor, um die Reproduzierbarkeit und Wiederverwendbarkeit von Modellierungsergebnissen zu verbessern. Meine Implementierungen wurden erfolgreich in internationalen Anwendungen integriert und fördern das Teilen von wissenschaftlichen Ergebnissen.20182018vorgelegt von Martin Scharmepub.dissertation1 Dissertation_Scharm_2018.pdf 14435471 cc2be003a5341aad2da7645f9a1cab86 rosdok/id000023151032983337Oau2018-10-172023-08-05T19:10:58ZrdaConverted from PICA to MODS using Pica2Mods XSLT Transformer 2.7 [SCM: "0c0e7a3c226a4a0cbcbec39b493c3c5257339ab8" "v2.7" "2023-08-04T00:00:00+0200"] with mode 'DEFAULT'.DissertationHochschulschriftImproving reproducibility and reuse of modelling results in the life sciencesResearch results are complex and include a variety of heterogeneous data. This entails major computational challenges to (i) to manage simulation studies, (ii) to ensure model exchangeability, stability and validity, and (iii) to foster communication between partners. I describe techniques to improve the reproducibility and reuse of modelling results. First, I introduce a method to characterise differences in computational models. Second, I present approaches to obtain shareable and reproducible research results. Altogether, my methods and tools foster exchange and reuse of modelling results.Die verteilte Entwicklung von komplexen Simulationsstudien birgt eine große Zahl an informationstechnischen Herausforderungen: (i) Modelle müssen verwaltet werden; (ii) Reproduzierbarkeit, Stabilität und Gültigkeit von Ergebnissen muss sichergestellt werden; und (iii) die Kommunikation zwischen Partnern muss verbessert werden. Ich stelle Techniken vor, um die Reproduzierbarkeit und Wiederverwendbarkeit von Modellierungsergebnissen zu verbessern. Meine Implementierungen wurden erfolgreich in internationalen Anwendungen integriert und fördern das Teilen von wissenschaftlichen Ergebnissen.MartinScharm1985 -VerfasserInaut11692264340000-0003-4519-7030OlafWolkenhauer1966 -AkademischeR BetreuerIndgs1335159310000-0001-6105-2937InaKochAkademischeR BetreuerIndgsClemens H.Cap1965 -AkademischeR BetreuerIndgs1217171860000-0003-3958-613638329-6Universität Rostock1419 -Grad-verleihende Institutiondgg10085032-7Universität RostockFakultät für Informatik und Elektrotechnik2004 -Grad-verleihende Institutiondgghttp://purl.uni-rostock.de/rosdok/id00002315urn:nbn:de:gbv:28-diss2018-0146-810.18453/rosdok_id00002315004 Informatik570 Biowissenschaften, BiologieFakultät für Informatik und ElektrotechnikCC BY-SA 4.0Nutzungsrechte erteiltLizenz Metadaten: CC0frei zugänglich (Open Access)en2018Universität RostockRostockmonographic201820182018Universitätsbibliothek RostockRostock2018Universitätsbibliothek Rostockhttp://purl.uni-rostock.de/rosdok/id00002315vorgelegt von Martin ScharmST 340WC 7700ReproduzierbarkeitWiederverwendungBiologisches Modell 2018-10-17T07:56:27.956Z 2023-08-08T10:09:21.091Z 2023-08-18T10:09:21.095Z {"identifier":"rosdok/id00002315","type":"local_id","additional":"","service":"MCRLocalID","created":"2018-10-17T07:56:28.083Z"} editorD {"identifier":"http://purl.uni-rostock.de/rosdok/id00002315","type":"purl","additional":"","service":"RosDokPURL","created":"2018-10-17T08:16:46.617Z","registered":"2018-10-17T08:16:46.617Z"} {"identifier":"10.18453/rosdok_id00002315","type":"doi","additional":"","service":"RosDokDOI","created":"2018-10-17T08:16:48.746Z","registered":"2018-10-17T08:16:48.746Z"} {"identifier":"urn:nbn:de:gbv:28-diss2018-0146-8","type":"dnbUrn","additional":"","service":"RosDokURN","created":"2018-10-17T07:56:28.172Z","registered":"2018-10-18T02:15:06.957Z"} administratorfulltextfile/rosdok_disshab_0000001974/rosdok_derivate_0000057395/Dissertation_Scharm_2018.pdfImproving reproducibility and reuse of modelling results in the life sciencesImproving reproducibility and reuse of modelling results in the life sciencesgnd:1169226434orcid:0000-0003-4519-7030gnd:133515931orcid:0000-0001-6105-2937gnd:121717186orcid:0000-0003-3958-6136gnd:38329-6gnd:10085032-7gnd:1169226434orcid:0000-0003-4519-7030gnd:133515931orcid:0000-0001-6105-2937gnd:121717186orcid:0000-0003-3958-6136gnd:38329-6gnd:10085032-7rosdok_disshab_0000001974-d571753e54gnd:1169226434orcid:0000-0003-4519-7030Martin ScharmMartin Scharmrosdok_disshab_0000001974-d571753e70gnd:133515931orcid:0000-0001-6105-2937Olaf WolkenhauerOlaf Wolkenhauerrosdok_disshab_0000001974-d571753e86Ina KochIna Kochrosdok_disshab_0000001974-d571753e97gnd:121717186orcid:0000-0003-3958-6136Clemens H. 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I describe techniques to…Martin ScharmImproving reproducibility and reuse of modelling results in the life sciencesUniversitätsbibliothek Rostockhttp://purl.uni-rostock.de/rosdok/id00002315MartinScharm1985 -VerfasserInaut11692264340000-0003-4519-7030OlafWolkenhauer1966 -AkademischeR BetreuerIndgs1335159310000-0001-6105-2937InaKochAkademischeR BetreuerIndgsClemens H.Cap1965 -AkademischeR BetreuerIndgs1217171860000-0003-3958-613638329-6Universität Rostock1419 -Grad-verleihende Institutiondgg10085032-7Universität RostockFakultät für Informatik und Elektrotechnik2004 -Grad-verleihende Institutiondgg[purl]http://purl.uni-rostock.de/rosdok/id00002315[urn]urn:nbn:de:gbv:28-diss2018-0146-8[doi]10.18453/rosdok_id00002315open_access20182018epoch:21th_centuryrfc5646:endoctype:epub.dissertationaccesscondition:openaccessSDNB:004SDNB:570institution:unirostock.iefstate:published