mycoreobjectrosdok_disshab_0000002498rosdok_disshab_0000002498rosdokdisshabrosdok_derivate_00001000142023-08-08T10:12:49.786Z2021-04-26T09:23:04.875ZadministratoreditorDpublished1rosdok_derivate_0000100014truetruederivate_types:fulltextVolltextfulltextwf_edit_epub wf_register_epubstate:publishedstate:publishedveröffentlichtpublishedrosdok/id000030041755927991Oau2021-04-262023-08-05T19:17:10ZrdaConverted from PICA to MODS using Pica2Mods XSLT Transformer 2.7 [SCM: "0c0e7a3c226a4a0cbcbec39b493c3c5257339ab8" "v2.7" "2023-08-04T00:00:00+0200"] with mode 'DEFAULT'.DissertationHochschulschriftEtablierung des E2F1-Interaktoms metastasierungsrelevanter Faktoren durch Integration bioinformatischer und experimenteller MethodenIn dieser Arbeit wurde durch intensive Literatur- und Datenbankrecherche ein Protein-Protein/Gen-Interaktionsnetzwerk um den Transkriptionsfaktor E2F1 herum erstellt. Er ist Schlüsselfaktor für die epithelial-mesenchymale Transition (EMT), Voraussetzung für die Metastasierung. Eine anschließende bioinformatische Analyse identifizierte tumorspezifische Signaturen der E2F1-vermittelten EMT, welche experimentell und anhand von Patientendaten validiert wurden. Gemeinsame Zielgene des näher untersuchten E2F1-TGFβ-Interaktoms bieten mögliche Therapieziele für Krebspatienten.By intensive literature and database research we constructed a comprehensive map of interactions around the transcription factor E2F1, a key driver of the epithelial-mesenchymal transition (EMT) as a prerequisite for metastasis. The subsequent bioinformatics analysis of this map lead to the identification of tumour-specific molecular signatures of E2F1-driven EMT. These signatures were validated experimentally as well as on patient data. Common transcriptional targets of the investigated E2F1-TGFβ co-regulome might be suitable therapeutic targets for cancer patients.StephanMarquardt1981 -VerfasserInaut123219865XBrigitte MariaPützer1962 -AkademischeR BetreuerIndgs122722388LarsKaderali1974 -AkademischeR BetreuerIndgs1319088980000-0002-2359-229438329-6Universität Rostock1419 -Grad-verleihende Institutiondgg2147083-2Universität RostockMathematisch-Naturwissenschaftliche FakultätGrad-verleihende Institutiondgghttp://purl.uni-rostock.de/rosdok/id00003004urn:nbn:de:gbv:28-rosdok_id00003004-410.18453/rosdok_id00003004570 Biowissenschaften, Biologie610 Medizin, GesundheitMathematisch-Naturwissenschaftliche FakultätCC BY-NC 4.0Nutzungsrechte erteiltLizenz Metadaten: CC0frei zugänglich (Open Access)de2019Universität RostockRostockmonographic202020192021Universitätsbibliothek RostockRostock2021Universitätsbibliothek Rostockhttp://purl.uni-rostock.de/rosdok/id00003004Für nähere Informationen zur bioinformatischen Analyse des E2F1-Netzwerkes, siehe die parallele Doktorarbeit von Faiz M. Khan: "An integrated workflow to study large-scale biochemical networks" der Fakultät für Informatik und Elektrotechnik der Universität Rostock. Teile beider Doktorarbeiten wurden publiziert unter: "Unraveling a tumor type-specific regulatory core underlying E2F1-mediated epithelial-mesenchymal transition to predict receptor protein signatures" Khan FM, Marquardt S, Gupta SK, Knoll S, Schmitz U, Spitschak A, Engelmann D, Vera J, Wolkenhauer O, Pützer BM. Nat Commun. 2017 Aug 4;8(1):198. doi: 10.1038/s41467-017-00268-2.Brigitte M. Pützer (Universitätsmedizin Rostock, Institut für Experimentelle Gentherapie und Tumorforschung) ; Lars Kaderali (Universität Greifswald, Institut für Bioinformatik)vorgelegt von Stephan MarquardtWG 1940GenregulationTranskriptionsfaktorProtein-Protein-WechselwirkungBioinformatikdoctype:epubdoctype:epubDokumenttypDocument typedoctype:epub.dissertationdoctype:epub.dissertationDissertationdoctoral thesisdiniPublType:doctoralThesis diniPublType2022:PhDThesis XMetaDissPlusThesisLevel:thesis.doctoralinfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisdocumentnatureOfContent:ppn_105825778natureOfContent:ppn_105825778HochschulschriftdiniPublType2022:DoctoralThesisdiniPublType2022:DoctoralThesisDissertation oder HabilitationDoctoral thesisDRIVERdiniPublType2022:PhDThesisdiniPublType2022:PhDThesisDissertationPhD thesisKDSF (Pu34)XMetaDissPlusThesisLevel:thesis.doctoralXMetaDissPlusThesisLevel:thesis.doctoralDoktorarbeitdoctoral thesisSDNB:570SDNB:570570 Biowissenschaften, Biologie570 Life scienceSDNB:610SDNB:610610 Medizin, Gesundheit610 Medical sciences Medicineinstitution:unirostockinstitution:unirostockUniversität RostockUniversity of RostockUniversität RostockUniversität RostockUni.Rostockhttp://d-nb.info/gnd/38329-6institution:unirostock.mnfinstitution:unirostock.mnfMathematisch-Naturwissenschaftliche FakultätFaculty of Mathematics and Natural SciencesUniversität Rostock. 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Er ist Schlüsselfaktor für die epithelial-mesenchymale Transition (EMT), Voraussetzung für die Metastasierung. Eine anschließende bioinformatische Analyse identifizierte tumorspezifische Signaturen der E2F1-vermittelten EMT, welche experimentell und anhand von Patientendaten validiert wurden. Gemeinsame Zielgene des näher untersuchten E2F1-TGFβ-Interaktoms bieten mögliche Therapieziele für Krebspatienten.By intensive literature and database research we constructed a comprehensive map of interactions around the transcription factor E2F1, a key driver of the epithelial-mesenchymal transition (EMT) as a prerequisite for metastasis. The subsequent bioinformatics analysis of this map lead to the identification of tumour-specific molecular signatures of E2F1-driven EMT. These signatures were validated experimentally as well as on patient data. Common transcriptional targets of the investigated E2F1-TGFβ co-regulome might be suitable therapeutic targets for cancer patients.20192019Für nähere Informationen zur bioinformatischen Analyse des E2F1-Netzwerkes, siehe die parallele Doktorarbeit von Faiz M. Khan: "An integrated workflow to study large-scale biochemical networks" der Fakultät für Informatik und Elektrotechnik der Universität Rostock. Teile beider Doktorarbeiten wurden publiziert unter: "Unraveling a tumor type-specific regulatory core underlying E2F1-mediated epithelial-mesenchymal transition to predict receptor protein signatures" Khan FM, Marquardt S, Gupta SK, Knoll S, Schmitz U, Spitschak A, Engelmann D, Vera J, Wolkenhauer O, Pützer BM. Nat Commun. 2017 Aug 4;8(1):198. doi: 10.1038/s41467-017-00268-2.Brigitte M. Pützer (Universitätsmedizin Rostock, Institut für Experimentelle Gentherapie und Tumorforschung) ; Lars Kaderali (Universität Greifswald, Institut für Bioinformatik)vorgelegt von Stephan Marquardtepub.dissertation1 Marquardt_Dissertation_2021.pdf 11402093 90bfceb26c4eae0269d397c26f8e342e rosdok/id000030041755927991Oau2021-04-262023-08-05T19:17:10ZrdaConverted from PICA to MODS using Pica2Mods XSLT Transformer 2.7 [SCM: "0c0e7a3c226a4a0cbcbec39b493c3c5257339ab8" "v2.7" "2023-08-04T00:00:00+0200"] with mode 'DEFAULT'.DissertationHochschulschriftEtablierung des E2F1-Interaktoms metastasierungsrelevanter Faktoren durch Integration bioinformatischer und experimenteller MethodenIn dieser Arbeit wurde durch intensive Literatur- und Datenbankrecherche ein Protein-Protein/Gen-Interaktionsnetzwerk um den Transkriptionsfaktor E2F1 herum erstellt. Er ist Schlüsselfaktor für die epithelial-mesenchymale Transition (EMT), Voraussetzung für die Metastasierung. 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Common transcriptional targets of the investigated E2F1-TGFβ co-regulome might be suitable therapeutic targets for cancer patients.20192019Für nähere Informationen zur bioinformatischen Analyse des E2F1-Netzwerkes, siehe die parallele Doktorarbeit von Faiz M. Khan: "An integrated workflow to study large-scale biochemical networks" der Fakultät für Informatik und Elektrotechnik der Universität Rostock. Teile beider Doktorarbeiten wurden publiziert unter: "Unraveling a tumor type-specific regulatory core underlying E2F1-mediated epithelial-mesenchymal transition to predict receptor protein signatures" Khan FM, Marquardt S, Gupta SK, Knoll S, Schmitz U, Spitschak A, Engelmann D, Vera J, Wolkenhauer O, Pützer BM. Nat Commun. 2017 Aug 4;8(1):198. doi: 10.1038/s41467-017-00268-2.Brigitte M. Pützer (Universitätsmedizin Rostock, Institut für Experimentelle Gentherapie und Tumorforschung) ; Lars Kaderali (Universität Greifswald, Institut für Bioinformatik)vorgelegt von Stephan Marquardt[xslt]Saxonrosdok/id00003004https://purl.uni-rostock.de/rosdok/id00003004175592799110.18453/rosdok_id00003004urn:nbn:de:gbv:28-rosdok_id00003004-4Stephan MarquardtMarquardt StephanEtablierung des E2F1-Interaktoms metastasierungsrelevanter Faktoren durch Integration bioinformatischer und experimenteller MethodenDissertationdoctoral thesisUniversität Rostock, 2019In dieser Arbeit wurde durch intensive Literatur- und Datenbankrecherche ein Protein-Protein/Gen-Interaktionsnetzwerk um den Transkriptionsfaktor E2F1 herum erstellt. Er ist Schlüsselfaktor für die epithelial-mesenchymale Transition (EMT), Voraussetzung für die Metastasierung. Eine anschließende…Stephan MarquardtEtablierung des E2F1-Interaktoms metastasierungsrelevanter Faktoren durch Integration bioinformatischer und experimenteller MethodenUniversitätsbibliothek Rostockhttp://purl.uni-rostock.de/rosdok/id00003004StephanMarquardt1981 -VerfasserInaut123219865XBrigitte MariaPützer1962 -AkademischeR BetreuerIndgs122722388LarsKaderali1974 -AkademischeR BetreuerIndgs1319088980000-0002-2359-229438329-6Universität Rostock1419 -Grad-verleihende Institutiondgg2147083-2Universität RostockMathematisch-Naturwissenschaftliche FakultätGrad-verleihende Institutiondgg[purl]http://purl.uni-rostock.de/rosdok/id00003004[urn]urn:nbn:de:gbv:28-rosdok_id00003004-4[doi]10.18453/rosdok_id00003004open_access20192019epoch:21th_centuryrfc5646:dedoctype:epub.dissertationaccesscondition:openaccessSDNB:570SDNB:610institution:unirostock.mnfstate:published