mycoreobjectrosdok_disshab_0000003075rosdok_disshab_0000003075rosdokdisshabrosdok_derivate_00002121502023-11-20T23:00:03.378Z2023-11-18T10:50:33.524ZMCRJANITOReditorMSpublished1rosdok_derivate_0000212150truetruederivate_types:fulltextVolltextfulltextwf_edit_epub wf_register_epubstate:publishedstate:publishedveröffentlichtpublishedrosdok/id000044661870620542Oau2023-11-182023-11-18T10:58:57ZrdaConverted from PICA to MODS using Pica2MODS XSLT Transformer 2.8 [SCM: "0dd72eb2002cd5e1d4341cacf34e92f44f7894b4" "v2.8" "2023-10-12T16:45:19+0200"] with mode 'DEFAULT'.DissertationHochschulschriftMassenspektrometrische Präzisionsanalyse eines Antikörper-Bindemotivs in der Linker-Region von C2H2-Zinkfinger-Proteinenvon der Charakterisierung der Epitop-Feinstruktur zur Antikörper-basierten Tumordiagnostik am Beispiel des EndometriumkarzinomsMittels ITEM-TWO untersuchte ich, inwieweit eine Tumordiagnostik mit dem anti-HpTGEKP-Antikörper von Aminosäureaustauschen/Phosphorylierungen im bipolaren Antikörperbindemotiv abhängig ist. Getestet wurden 15 Peptidsequenzen: Die 10 häufigsten C2H2-Zinkfinger-Linker und der im Endometriumkarzinom im ZNF331-Gen gehäuft vorkommende H11Y-Austausch, inkl. Phosphorylierungen. Dabei führte die präzisere Differenzierung von Antikörperbindungen zur Einteilung in ‚orthodoxe/unorthodoxe‘ Epitop-Paratop-Bindungstypen, was wegweisend zur Charakterisierung künftiger Antikörperdiagnostika/-therapeutika ist.I applied ITEM-TWO to investigate whether tumor diagnosis with the anti-HpTGEKP antibody depended on amino acid exchanges/phosphorylations within its bipolar binding motif. 15 peptides were tested: The 10 most common C2H2 zinc finger linkers and linkers carrying the H11Y exchange plus phosphorylations, caused by mutation of the ZNF331 gene in uterine corpus endometrial carcinoma. To reach my goal I needed to further differentiate specific antibody binding introducing a novel 'orthodox/unorthodox' binding type, which will improve assessment of future antibody-based diagnostics/therapeutics.MaximilianScherf1995 -VerfasserInaut13103046960000-0003-0604-236XMichaelGlocker1960 -AkademischeR BetreuerIndgs10140521650000-0001-9190-482XToralfReimer1968 -AkademischeR BetreuerIndgs114954453Gynäkologie, Klinikum Südstadt RostockC. H.BorchersAkademischeR BetreuerIndgs10461254190000-0003-2394-651238329-6Universität Rostock1419 -Grad-verleihende Institutiondgg1029510660Universitätsmedizin RostockGrad-verleihende Institutiondgghttps://purl.uni-rostock.de/rosdok/id00004466urn:nbn:de:gbv:28-rosdok_id00004466-910.18453/rosdok_id00004466610 Medizin, GesundheitUniversitätsmedizinCC BY 4.0Nutzungsrechte erteiltLizenz Metadaten: CC0frei zugänglich (Open Access)de2023Universität RostockRostockmonographic202320232023Universitätsbibliothek RostockRostock2023Universitätsbibliothek Rostockhttps://purl.uni-rostock.de/rosdok/id00004466Artikel in Fachzeitschriften: 08/2022 (Erstautor): Epitope fine mapping by mass spectrometry: Investigations of immune complexes consisting of monoclonal anti‐HpTGEKP- antibody and zinc finger protein linker phospho‐hexapeptides Scherf M, Danquah BD, Koy C, Lorenz P, Steinbeck F, Neamtu A, Thiesen H-J, Glocker MO ChemBioChem. 2022;23(20). 01/2023 (Erstautor): Characterization of Phosphorylation-Dependent Antibody Binding to Cancer-Mutated Linkers of C2H2 Zinc Finger Proteins by Intact Transition Epitope Mapping-Thermodynamic Weak-Force Order Analysis Scherf M, Koy C, Röwer C, Neamtu A, Glocker MO. J Am Soc Mass Spectrom. 2023;34(2):171-81. Konferenzbeiträge: 06/2022 (Erstautor): Mass Spectrometric Binding Strength Characterization of Paratope - Epitope Interactions with Amino Acid Residue Resolution: Towards Deciphering Molecular “Recognition Codes” Scherf M, Danquah BD, Koy C, Lorenz P, Steinbeck, F Neamtu A, Thiesen H-J, Glocker MO. 70th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics. Minneapolis, Minnesota, USA. 05/2023 (Co-Autor): Mass Spectrometric ITEM-TWO Investigations and Bio- Computational Analyses of Phosphorylation-Dependent Antibody Binding to Cancer-Mutated Linkers of C2H2 Zinc Finger Proteins Koy C, Scherf M, Röwer C, Neamtu A, Glocker MO. 54th Annual Conference of the German Society for Mass Spectrometry. Dortmund, Germany. 08/2023 (Co-Autor): Mass Spectrometric ITEM-TWO Investigations and Bio-Computational Analyses of Phosphorylation-Dependent Antibody Binding to Cancer-Mutated Linkers of C2H2 Zinc Finger Proteins Koy C, Scherf M, Röwer C, Neamtu A, Glocker MO. 16th German Peptide Symposium. Jena, Germany.Michael O. Glocker (Proteomzentrum Rostock, Abteilung für Proteomforschung, Universitätsmedizin und Naturwissenschaftliche Fakultät, Universität Rostock) ; Toralf Reimer (Gynäkologie, Klinikum Südstadt Rostock) ; Christoph Borchers (Centre for Translational Research in Cancer, McGill University, Lady Davis Institute for Medical Research, Jewish General Hospital, Montréal, Québec, Kanada)[{"name":"Glocker, Michael O.","affil":"Proteomzentrum Rostock, Abteilung für Proteomforschung, Universitätsmedizin und Naturwissenschaftliche Fakultät, Universität Rostock"},{"name":"Reimer, Toralf","affil":"Gynäkologie, Klinikum Südstadt Rostock"},{"name":"Borchers, Christoph","affil":"Centre for Translational Research in Cancer, McGill University, Lady Davis Institute for Medical Research, Jewish General Hospital, Montréal, Québec, Kanada"}]vorgelegt von Maximilian ScherfGlocker, Michael O.Proteomzentrum Rostock, Abteilung für Proteomforschung, Universitätsmedizin und Naturwissenschaftliche Fakultät, Universität RostockReimer, ToralfGynäkologie, Klinikum Südstadt RostockBorchers, ChristophCentre for Translational Research in Cancer, McGill University, Lady Davis Institute for Medical Research, Jewish General Hospital, Montréal, Québec, Kanadadoctype:epubdoctype:epubDokumenttypDocument typedoctype:epub.dissertationdoctype:epub.dissertationDissertationdoctoral thesisdiniPublType:doctoralThesis diniPublType2022:PhDThesis XMetaDissPlusThesisLevel:thesis.doctoralinfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisdocumentnatureOfContent:ppn_105825778natureOfContent:ppn_105825778HochschulschriftdiniPublType2022:DoctoralThesisdiniPublType2022:DoctoralThesisDissertation oder HabilitationDoctoral thesisDRIVERdiniPublType2022:PhDThesisdiniPublType2022:PhDThesisDissertationPhD thesisKDSF (Pu34)XMetaDissPlusThesisLevel:thesis.doctoralXMetaDissPlusThesisLevel:thesis.doctoralDoktorarbeitdoctoral thesisSDNB:610SDNB:610610 Medizin, Gesundheit610 Medical sciences Medicineinstitution:unirostockinstitution:unirostockUniversität RostockUniversity of RostockUniversität RostockUniversität RostockUni.Rostockhttp://d-nb.info/gnd/38329-6institution:unirostock.umrinstitution:unirostock.umrUniversitätsmedizinUniversity MedicineUniversität Rostock. 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H. BorchersC. H. Borchersrosdok_disshab_0000003075-d371689e117gnd:38329-6Universität RostockUniversität Rostockrosdok_disshab_0000003075-d371689e128gnd:1029510660Universitätsmedizin RostockUniversitätsmedizin RostockMaximilian ScherfMichael GlockerToralf ReimerC. H. BorchersUniversität RostockUniversitätsmedizin RostockMaximilian ScherfMichael GlockerToralf ReimerC. H. BorchersUniversität RostockUniversitätsmedizin RostockMaximilian ScherfRostockUniversität Rostockepub.dissertationhttps://purl.uni-rostock.de/rosdok/id00004466urn:nbn:de:gbv:28-rosdok_id00004466-910.18453/rosdok_id00004466Mittels ITEM-TWO untersuchte ich, inwieweit eine Tumordiagnostik mit dem anti-HpTGEKP-Antikörper von Aminosäureaustauschen/Phosphorylierungen im bipolaren Antikörperbindemotiv abhängig ist. Getestet wurden 15 Peptidsequenzen: Die 10 häufigsten C2H2-Zinkfinger-Linker und der im Endometriumkarzinom im ZNF331-Gen gehäuft vorkommende H11Y-Austausch, inkl. Phosphorylierungen. 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Getestet wurden 15 Peptidsequenzen: Die 10 häufigsten C2H2-Zinkfinger-Linker und der im Endometriumkarzinom im ZNF331-Gen gehäuft vorkommende H11Y-Austausch, inkl. Phosphorylierungen. Dabei führte die präzisere Differenzierung von Antikörperbindungen zur Einteilung in ‚orthodoxe/unorthodoxe‘ Epitop-Paratop-Bindungstypen, was wegweisend zur Charakterisierung künftiger Antikörperdiagnostika/-therapeutika ist.I applied ITEM-TWO to investigate whether tumor diagnosis with the anti-HpTGEKP antibody depended on amino acid exchanges/phosphorylations within its bipolar binding motif. 15 peptides were tested: The 10 most common C2H2 zinc finger linkers and linkers carrying the H11Y exchange plus phosphorylations, caused by mutation of the ZNF331 gene in uterine corpus endometrial carcinoma. 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Dabei führte die präzisere Differenzierung von Antikörperbindungen zur Einteilung in ‚orthodoxe/unorthodoxe‘ Epitop-Paratop-Bindungstypen, was wegweisend zur Charakterisierung künftiger Antikörperdiagnostika/-therapeutika ist.I applied ITEM-TWO to investigate whether tumor diagnosis with the anti-HpTGEKP antibody depended on amino acid exchanges/phosphorylations within its bipolar binding motif. 15 peptides were tested: The 10 most common C2H2 zinc finger linkers and linkers carrying the H11Y exchange plus phosphorylations, caused by mutation of the ZNF331 gene in uterine corpus endometrial carcinoma. To reach my goal I needed to further differentiate specific antibody binding introducing a novel 'orthodox/unorthodox' binding type, which will improve assessment of future antibody-based diagnostics/therapeutics.20232023Artikel in Fachzeitschriften: 08/2022 (Erstautor): Epitope fine mapping by mass spectrometry: Investigations of immune complexes consisting of monoclonal anti‐HpTGEKP- antibody and zinc finger protein linker phospho‐hexapeptides Scherf M, Danquah BD, Koy C, Lorenz P, Steinbeck F, Neamtu A, Thiesen H-J, Glocker MO ChemBioChem. 2022;23(20). 01/2023 (Erstautor): Characterization of Phosphorylation-Dependent Antibody Binding to Cancer-Mutated Linkers of C2H2 Zinc Finger Proteins by Intact Transition Epitope Mapping-Thermodynamic Weak-Force Order Analysis Scherf M, Koy C, Röwer C, Neamtu A, Glocker MO. J Am Soc Mass Spectrom. 2023;34(2):171-81. Konferenzbeiträge: 06/2022 (Erstautor): Mass Spectrometric Binding Strength Characterization of Paratope - Epitope Interactions with Amino Acid Residue Resolution: Towards Deciphering Molecular “Recognition Codes” Scherf M, Danquah BD, Koy C, Lorenz P, Steinbeck, F Neamtu A, Thiesen H-J, Glocker MO. 70th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics. Minneapolis, Minnesota, USA. 05/2023 (Co-Autor): Mass Spectrometric ITEM-TWO Investigations and Bio- Computational Analyses of Phosphorylation-Dependent Antibody Binding to Cancer-Mutated Linkers of C2H2 Zinc Finger Proteins Koy C, Scherf M, Röwer C, Neamtu A, Glocker MO. 54th Annual Conference of the German Society for Mass Spectrometry. Dortmund, Germany. 08/2023 (Co-Autor): Mass Spectrometric ITEM-TWO Investigations and Bio-Computational Analyses of Phosphorylation-Dependent Antibody Binding to Cancer-Mutated Linkers of C2H2 Zinc Finger Proteins Koy C, Scherf M, Röwer C, Neamtu A, Glocker MO. 16th German Peptide Symposium. Jena, Germany.Michael O. Glocker (Proteomzentrum Rostock, Abteilung für Proteomforschung, Universitätsmedizin und Naturwissenschaftliche Fakultät, Universität Rostock) ; Toralf Reimer (Gynäkologie, Klinikum Südstadt Rostock) ; Christoph Borchers (Centre for Translational Research in Cancer, McGill University, Lady Davis Institute for Medical Research, Jewish General Hospital, Montréal, Québec, Kanada)[{"name":"Glocker, Michael O.","affil":"Proteomzentrum Rostock, Abteilung für Proteomforschung, Universitätsmedizin und Naturwissenschaftliche Fakultät, Universität Rostock"},{"name":"Reimer, Toralf","affil":"Gynäkologie, Klinikum Südstadt Rostock"},{"name":"Borchers, Christoph","affil":"Centre for Translational Research in Cancer, McGill University, Lady Davis Institute for Medical Research, Jewish General Hospital, Montréal, Québec, Kanada"}]vorgelegt von Maximilian Scherf[xslt]Saxonrosdok/id00004466https://purl.uni-rostock.de/rosdok/id00004466187062054210.18453/rosdok_id00004466urn:nbn:de:gbv:28-rosdok_id00004466-9Maximilian ScherfScherf MaximilianMassenspektrometrische Präzisionsanalyse eines Antikörper-Bindemotivs in der Linker-Region von C2H2-Zinkfinger-Proteinen : von der Charakterisierung der Epitop-Feinstruktur zur Antikörper-basierten Tumordiagnostik am Beispiel des EndometriumkarzinomsDissertationdoctoral thesisUniversität Rostock, 2023Mittels ITEM-TWO untersuchte ich, inwieweit eine Tumordiagnostik mit dem anti-HpTGEKP-Antikörper von Aminosäureaustauschen/Phosphorylierungen im bipolaren Antikörperbindemotiv abhängig ist. Getestet wurden 15 Peptidsequenzen: Die 10 häufigsten C2H2-Zinkfinger-Linker und der im Endometriumkarzinom im…Maximilian ScherfMassenspektrometrische Präzisionsanalyse eines Antikörper-Bindemotivs in der Linker-Region von C2H2-Zinkfinger-Proteinenvon der Charakterisierung der Epitop-Feinstruktur zur Antikörper-basierten Tumordiagnostik am Beispiel des EndometriumkarzinomsUniversitätsbibliothek Rostockhttps://purl.uni-rostock.de/rosdok/id00004466MaximilianScherf1995 -VerfasserInaut13103046960000-0003-0604-236XMichaelGlocker1960 -AkademischeR BetreuerIndgs10140521650000-0001-9190-482XToralfReimer1968 -AkademischeR BetreuerIndgs114954453Gynäkologie, Klinikum Südstadt RostockC. H.BorchersAkademischeR BetreuerIndgs10461254190000-0003-2394-651238329-6Universität Rostock1419 -Grad-verleihende Institutiondgg1029510660Universitätsmedizin RostockGrad-verleihende Institutiondgg[purl]https://purl.uni-rostock.de/rosdok/id00004466[urn]urn:nbn:de:gbv:28-rosdok_id00004466-9[doi]10.18453/rosdok_id00004466open_access20232023epoch:21th_centuryrfc5646:dedoctype:epub.dissertationaccesscondition:openaccessSDNB:610institution:unirostock.umrstate:published