mycoreobjectrosdok_disshab_0000003146rosdok_disshab_0000003146rosdokdisshabrosdok_derivate_00002216482024-06-01T22:00:08.761Z2024-05-31T15:31:15.813ZMCRJANITOReditorFGpublished1rosdok_derivate_0000221648truetruederivate_types:fulltextVolltextfulltextwf_edit_epub wf_register_epubstate:publishedstate:publishedveröffentlichtpublishedrosdok/id000045971890442402Oau2024-05-312024-05-31T15:51:29ZrdaConverted from PICA to MODS using Pica2MODS XSLT Transformer 2.10 [SCM: "f6c168af690edb7cb65ef34e4a2bf7f8714c5d38" "v2.10" "2024-03-28T14:43:08+0100"] with mode 'DEFAULT'.DissertationHochschulschriftOf plants and pixels: leveraging biological priors for ecological data analysis when generic methods fall shortThis interdisciplinary PhD project aimed to accelerate several data analysis tasks in ecological research that are too timeconsuming to perform manually. For some specific tasks, such as instance segmentation of tree rings or root turnover estimation, the performance of existing, generic methods failed to meet the desired level of accuracy. This led to the development of new algorithms which constitute the main part of this thesis. Incorporating domain-specific prior knowledge has shown to be essential in their development.Ziel dieser interdisziplinären Arbeit war es, mehrere Datenanalyseaufgaben in der ökologischen Forschung zu beschleunigen, die für manuelle Durchführung zu zeitaufwändig sind. Für einige spezifische Aufgaben, wie z.B. die Instanzsegmentierung von Baumringen oder die Schätzung des Wurzelumsatzes, erfüllte die Erkennungsleistung vorhandener, generischer Methoden nicht das gewünschte Genauigkeitsniveau. Dies führte zur Entwicklung neuer Algorithmen, die den Hauptteil dieser Arbeit ausmachen. Einbeziehung von domänenspezifischem Vorwissen hat sich als wesentlich für deren Entwicklung erwiesen.AlexanderGillert1989 -VerfasserInaut1331357764UweLukasFreiherr von1967 -AkademischeR BetreuerIndgs128388951OliverStaadt1968 -AkademischeR BetreuerIndgs1231365390000-0002-3074-943XUniversity of RostockReinhardKoch1958 -AkademischeR BetreuerIndgs1015521614Christian-Albrecht University of Kiel38329-6Universität Rostock1419 -Grad-verleihende Institutiondgg10085032-7Universität Rostock. Fakultät für Informatik und Elektrotechnik2004 -Grad-verleihende Institutiondgghttps://purl.uni-rostock.de/rosdok/id00004597urn:nbn:de:gbv:28-rosdok_id00004597-110.18453/rosdok_id00004597000 Allgemeines, Wissenschaft004 Informatik580 Pflanzen (Botanik)Fakultät für Informatik und Elektrotechnikalle Rechte vorbehaltenNutzungsrechte erteiltLizenz Metadaten: CC0frei zugänglich (Open Access)en1 Online-Ressource (118 Seiten)2023Universität RostockRostockmonographic202320232024Universitätsbibliothek RostockRostock2024Universitätsbibliothek Rostockhttps://purl.uni-rostock.de/rosdok/id00004597Enthält ZeitschriftenartikelUwe Freiherr von Lukas (University of Rostock, Fraunhofer IGD) ; Oliver Staadt (University of Rostock) ; Reinhard Koch (Christian-Albrecht University of Kiel)[{"name":"Freiherr von Lukas, Uwe","affil":"University of Rostock, Fraunhofer IGD"},{"name":"Staadt, Oliver","affil":"University of Rostock"},{"name":"Koch, Reinhard","affil":"Christian-Albrecht University of Kiel"}]Dissertation, Universität Rostock, 2023, Kumulative Dissertationvorgelegt von Alexander GillertFreiherr von Lukas, UweUniversity of Rostock, Fraunhofer IGDStaadt, OliverUniversity of RostockKoch, ReinhardChristian-Albrecht University of Kieldoctype:epubdoctype:epubDokumenttypDocument typedoctype:epub.dissertationdoctype:epub.dissertationDissertationdoctoral thesisdiniPublType:doctoralThesis diniPublType2022:PhDThesis XMetaDissPlusThesisLevel:thesis.doctoralinfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisdocumentnatureOfContent:ppn_105825778natureOfContent:ppn_105825778HochschulschriftdiniPublType2022:DoctoralThesisdiniPublType2022:DoctoralThesisDissertation oder HabilitationDoctoral thesisDRIVERdiniPublType2022:PhDThesisdiniPublType2022:PhDThesisDissertationPhD thesisKDSF (Pu34)XMetaDissPlusThesisLevel:thesis.doctoralXMetaDissPlusThesisLevel:thesis.doctoralDoktorarbeitdoctoral thesisSDNB:000SDNB:000000 Allgemeines, Wissenschaft000 Generalities, ScienceSDNB:004SDNB:004004 Informatik004 Data processing Computer sciencesSDNB:580SDNB:580580 Pflanzen (Botanik)580 Botanical sciencesinstitution:unirostockinstitution:unirostockUniversität RostockUniversity of RostockUniversität RostockUniversität RostockUni.Rostockhttp://d-nb.info/gnd/38329-6institution:unirostock.iefinstitution:unirostock.iefFakultät für Informatik und ElektrotechnikFaculty of Computer Science and Electrical EngineeringUniversität Rostock. Fakultät für Informatik und ElektrotechnikFakultät für Informatik<br />und ElektrotechnikUni.Rostock.Fakultaet.IEFhttp://d-nb.info/gnd/10085032-7licenseinfo:worklicenseinfo:workWerkworklicenseinfo:work.rightsreservedlicenseinfo:work.rightsreservedalle Rechte vorbehaltenall rights reserved/creativecommons/r/reserved/0.9/88x31.png[DE-28]Urheberrechtsschutz 1.0$gRights Statements$uhttp://rightsstatements.org/vocab/InC/1.0/http://rightsstatements.org/vocab/InC/1.0/http://rightsstatements.org/vocab/InC/1.0/licenseinfo:depositlicenseinfo:depositVeröffentlichungsgenehmigungpermission to storelicenseinfo:deposit.rightsgrantedlicenseinfo:deposit.rightsgrantedNutzungsrechte erteiltrights grantedlicenseinfo:metadatalicenseinfo:metadataLizenzen für Metadatenlicenseinfo:metadata.cc0licenseinfo:metadata.cc0Lizenz Metadaten: CC0license metadata: CC0/creativecommons/p/zero/1.0/88x31.pnghttps://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/accesscondition:openaccessaccesscondition:openaccessfrei zugänglich (Open Access)open accesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2OAfreeinfo:eu-repo/semantics/openAccess[DE-28]Open Access$gControlled Vocabulary for Access Rights$uhttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2rfc5646:enrfc5646:enEnglischEnglishengengOf plants and pixels: leveraging biological priors for ecological data analysis when generic methods fall shortOf plants and pixels: leveraging biological priors for ecological data analysis when generic methods fall shortgnd:1331357764gnd:128388951gnd:123136539orcid:0000-0002-3074-943Xgnd:1015521614gnd:38329-6gnd:10085032-7gnd:1331357764gnd:128388951gnd:123136539orcid:0000-0002-3074-943Xgnd:1015521614gnd:38329-6gnd:10085032-7rosdok_disshab_0000003146-d2764387e54gnd:1331357764Alexander GillertAlexander Gillertrosdok_disshab_0000003146-d2764387e68gnd:128388951Uwe Lukas Freiherr vonUwe Lukas Freiherr vonrosdok_disshab_0000003146-d2764387e84gnd:123136539orcid:0000-0002-3074-943XOliver StaadtOliver Staadtrosdok_disshab_0000003146-d2764387e102gnd:1015521614Reinhard KochReinhard Kochrosdok_disshab_0000003146-d2764387e117gnd:38329-6Universität RostockUniversität Rostockrosdok_disshab_0000003146-d2764387e128gnd:10085032-7Universität Rostock. Fakultät für Informatik und ElektrotechnikUniversität Rostock. Fakultät für Informatik und ElektrotechnikAlexander GillertUwe Lukas Freiherr vonOliver StaadtReinhard KochUniversität RostockUniversität Rostock. Fakultät für Informatik und ElektrotechnikAlexander GillertUwe Lukas Freiherr vonOliver StaadtReinhard KochUniversität RostockUniversität Rostock. Fakultät für Informatik und ElektrotechnikAlexander GillertRostockUniversität Rostockepub.dissertationhttps://purl.uni-rostock.de/rosdok/id00004597urn:nbn:de:gbv:28-rosdok_id00004597-110.18453/rosdok_id00004597This interdisciplinary PhD project aimed to accelerate several data analysis tasks in ecological research that are too timeconsuming to perform manually. For some specific tasks, such as instance segmentation of tree rings or root turnover estimation, the performance of existing, generic methods failed to meet the desired level of accuracy. This led to the development of new algorithms which constitute the main part of this thesis. Incorporating domain-specific prior knowledge has shown to be essential in their development.Ziel dieser interdisziplinären Arbeit war es, mehrere Datenanalyseaufgaben in der ökologischen Forschung zu beschleunigen, die für manuelle Durchführung zu zeitaufwändig sind. Für einige spezifische Aufgaben, wie z.B. die Instanzsegmentierung von Baumringen oder die Schätzung des Wurzelumsatzes, erfüllte die Erkennungsleistung vorhandener, generischer Methoden nicht das gewünschte Genauigkeitsniveau. Dies führte zur Entwicklung neuer Algorithmen, die den Hauptteil dieser Arbeit ausmachen. Einbeziehung von domänenspezifischem Vorwissen hat sich als wesentlich für deren Entwicklung erwiesen.20232023Enthält ZeitschriftenartikelUwe Freiherr von Lukas (University of Rostock, Fraunhofer IGD) ; Oliver Staadt (University of Rostock) ; Reinhard Koch (Christian-Albrecht University of Kiel)[{"name":"Freiherr von Lukas, Uwe","affil":"University of Rostock, Fraunhofer IGD"},{"name":"Staadt, Oliver","affil":"University of Rostock"},{"name":"Koch, Reinhard","affil":"Christian-Albrecht University of Kiel"}]Dissertation, Universität Rostock, 2023, Kumulative Dissertationvorgelegt von Alexander Gillertepub.dissertation1 Gillert_Dissertation_2024.pdf 56412177 b6b53e3e6a91da6cbcca391071f5ffec rosdok/id000045971890442402Oau2024-05-312024-05-31T15:51:29ZrdaConverted from PICA to MODS using Pica2MODS XSLT Transformer 2.10 [SCM: "f6c168af690edb7cb65ef34e4a2bf7f8714c5d38" "v2.10" "2024-03-28T14:43:08+0100"] with mode 'DEFAULT'.DissertationHochschulschriftOf plants and pixels: leveraging biological priors for ecological data analysis when generic methods fall shortThis interdisciplinary PhD project aimed to accelerate several data analysis tasks in ecological research that are too timeconsuming to perform manually. For some specific tasks, such as instance segmentation of tree rings or root turnover estimation, the performance of existing, generic methods failed to meet the desired level of accuracy. This led to the development of new algorithms which constitute the main part of this thesis. Incorporating domain-specific prior knowledge has shown to be essential in their development.Ziel dieser interdisziplinären Arbeit war es, mehrere Datenanalyseaufgaben in der ökologischen Forschung zu beschleunigen, die für manuelle Durchführung zu zeitaufwändig sind. Für einige spezifische Aufgaben, wie z.B. die Instanzsegmentierung von Baumringen oder die Schätzung des Wurzelumsatzes, erfüllte die Erkennungsleistung vorhandener, generischer Methoden nicht das gewünschte Genauigkeitsniveau. Dies führte zur Entwicklung neuer Algorithmen, die den Hauptteil dieser Arbeit ausmachen. Einbeziehung von domänenspezifischem Vorwissen hat sich als wesentlich für deren Entwicklung erwiesen.AlexanderGillert1989 -VerfasserInaut1331357764UweLukasFreiherr von1967 -AkademischeR BetreuerIndgs128388951OliverStaadt1968 -AkademischeR BetreuerIndgs1231365390000-0002-3074-943XUniversity of RostockReinhardKoch1958 -AkademischeR BetreuerIndgs1015521614Christian-Albrecht University of Kiel38329-6Universität Rostock1419 -Grad-verleihende Institutiondgg10085032-7Universität Rostock. Fakultät für Informatik und Elektrotechnik2004 -Grad-verleihende Institutiondgghttps://purl.uni-rostock.de/rosdok/id00004597urn:nbn:de:gbv:28-rosdok_id00004597-110.18453/rosdok_id00004597000 Allgemeines, Wissenschaft004 Informatik580 Pflanzen (Botanik)Fakultät für Informatik und Elektrotechnikalle Rechte vorbehaltenNutzungsrechte erteiltLizenz Metadaten: CC0frei zugänglich (Open Access)en1 Online-Ressource (118 Seiten)2023Universität RostockRostockmonographic202320232024Universitätsbibliothek RostockRostock2024Universitätsbibliothek Rostockhttps://purl.uni-rostock.de/rosdok/id00004597Enthält ZeitschriftenartikelUwe Freiherr von Lukas (University of Rostock, Fraunhofer IGD) ; Oliver Staadt (University of Rostock) ; Reinhard Koch (Christian-Albrecht University of Kiel)[{"name":"Freiherr von Lukas, Uwe","affil":"University of Rostock, Fraunhofer IGD"},{"name":"Staadt, Oliver","affil":"University of Rostock"},{"name":"Koch, Reinhard","affil":"Christian-Albrecht University of Kiel"}]Dissertation, Universität Rostock, 2023, Kumulative Dissertationvorgelegt von Alexander Gillert Freiherr von Lukas, Uwe University of Rostock, Fraunhofer IGD Staadt, Oliver University of Rostock Koch, Reinhard Christian-Albrecht University of Kiel 2024-05-31T15:31:15.813Z 2024-06-01T22:00:08.761Z 2024-06-11T22:00:08.780Z editorFG {"identifier":"rosdok/id00004597","type":"local_id","additional":"","service":"MCRLocalID","created":"2024-05-31T15:31:15.836Z"} {"identifier":"https://purl.uni-rostock.de/rosdok/id00004597","type":"purl","additional":"","service":"RosDokPURL","created":"2024-05-31T15:31:15.848Z","registrationStarted":"2024-05-31T15:59:41.972Z"} {"identifier":"10.18453/rosdok_id00004597","type":"doi","additional":"","service":"RosDokDOI","created":"2024-05-31T15:31:15.851Z","registrationStarted":"2024-05-31T15:59:41.677Z","registered":"2024-05-31T15:59:43.067Z"} {"identifier":"urn:nbn:de:gbv:28-rosdok_id00004597-1","type":"dnbUrn","additional":"","service":"RosDokURN","created":"2024-05-31T15:31:15.843Z","registered":"2024-06-01T13:01:47.643Z"} MCRJANITORfulltextfile/rosdok_disshab_0000003146/rosdok_derivate_0000221648/Gillert_Dissertation_2024.pdfOf plants and pixels: leveraging biological priors for ecological data analysis when generic methods fall shortOf plants and pixels: leveraging biological priors for ecological data analysis when generic methods fall shortgnd:1331357764gnd:128388951gnd:123136539orcid:0000-0002-3074-943Xgnd:1015521614gnd:38329-6gnd:10085032-7gnd:1331357764gnd:128388951gnd:123136539orcid:0000-0002-3074-943Xgnd:1015521614gnd:38329-6gnd:10085032-7rosdok_disshab_0000003146-d2764387e54gnd:1331357764Alexander GillertAlexander Gillertrosdok_disshab_0000003146-d2764387e68gnd:128388951Uwe Lukas Freiherr vonUwe Lukas Freiherr vonrosdok_disshab_0000003146-d2764387e84gnd:123136539orcid:0000-0002-3074-943XOliver StaadtOliver Staadtrosdok_disshab_0000003146-d2764387e102gnd:1015521614Reinhard KochReinhard Kochrosdok_disshab_0000003146-d2764387e117gnd:38329-6Universität RostockUniversität Rostockrosdok_disshab_0000003146-d2764387e128gnd:10085032-7Universität Rostock. Fakultät für Informatik und ElektrotechnikUniversität Rostock. Fakultät für Informatik und ElektrotechnikAlexander GillertUwe Lukas Freiherr vonOliver StaadtReinhard KochUniversität RostockUniversität Rostock. Fakultät für Informatik und ElektrotechnikAlexander GillertUwe Lukas Freiherr vonOliver StaadtReinhard KochUniversität RostockUniversität Rostock. Fakultät für Informatik und ElektrotechnikAlexander GillertRostockUniversität Rostockepub.dissertationhttps://purl.uni-rostock.de/rosdok/id00004597urn:nbn:de:gbv:28-rosdok_id00004597-110.18453/rosdok_id00004597This interdisciplinary PhD project aimed to accelerate several data analysis tasks in ecological research that are too timeconsuming to perform manually. For some specific tasks, such as instance segmentation of tree rings or root turnover estimation, the performance of existing, generic methods failed to meet the desired level of accuracy. This led to the development of new algorithms which constitute the main part of this thesis. Incorporating domain-specific prior knowledge has shown to be essential in their development.Ziel dieser interdisziplinären Arbeit war es, mehrere Datenanalyseaufgaben in der ökologischen Forschung zu beschleunigen, die für manuelle Durchführung zu zeitaufwändig sind. Für einige spezifische Aufgaben, wie z.B. die Instanzsegmentierung von Baumringen oder die Schätzung des Wurzelumsatzes, erfüllte die Erkennungsleistung vorhandener, generischer Methoden nicht das gewünschte Genauigkeitsniveau. Dies führte zur Entwicklung neuer Algorithmen, die den Hauptteil dieser Arbeit ausmachen. Einbeziehung von domänenspezifischem Vorwissen hat sich als wesentlich für deren Entwicklung erwiesen.20232023Enthält ZeitschriftenartikelUwe Freiherr von Lukas (University of Rostock, Fraunhofer IGD) ; Oliver Staadt (University of Rostock) ; Reinhard Koch (Christian-Albrecht University of Kiel)[{"name":"Freiherr von Lukas, Uwe","affil":"University of Rostock, Fraunhofer IGD"},{"name":"Staadt, Oliver","affil":"University of Rostock"},{"name":"Koch, Reinhard","affil":"Christian-Albrecht University of Kiel"}]Dissertation, Universität Rostock, 2023, Kumulative Dissertationvorgelegt von Alexander Gillert[xslt]Saxonrosdok/id00004597https://purl.uni-rostock.de/rosdok/id00004597189044240210.18453/rosdok_id00004597urn:nbn:de:gbv:28-rosdok_id00004597-1Alexander GillertGillert AlexanderOf plants and pixels: leveraging biological priors for ecological data analysis when generic methods fall shortDissertationdoctoral thesisUniversität Rostock, 2023This interdisciplinary PhD project aimed to accelerate several data analysis tasks in ecological research that are too timeconsuming to perform manually. For some specific tasks, such as instance segmentation of tree rings or root turnover estimation, the performance of existing, generic methods…Alexander GillertOf plants and pixels: leveraging biological priors for ecological data analysis when generic methods fall shortUniversitätsbibliothek Rostockhttps://purl.uni-rostock.de/rosdok/id00004597AlexanderGillert1989 -VerfasserInaut1331357764UweLukasFreiherr von1967 -AkademischeR BetreuerIndgs128388951OliverStaadt1968 -AkademischeR BetreuerIndgs1231365390000-0002-3074-943XUniversity of RostockReinhardKoch1958 -AkademischeR BetreuerIndgs1015521614Christian-Albrecht University of Kiel38329-6Universität Rostock1419 -Grad-verleihende Institutiondgg10085032-7Universität Rostock. Fakultät für Informatik und Elektrotechnik2004 -Grad-verleihende Institutiondgg[purl]https://purl.uni-rostock.de/rosdok/id00004597[urn]urn:nbn:de:gbv:28-rosdok_id00004597-1[doi]10.18453/rosdok_id00004597open_access20232023epoch:21th_centuryrfc5646:endoctype:epub.dissertationaccesscondition:openaccessSDNB:000SDNB:004SDNB:580institution:unirostock.iefstate:published