title: |
Stochastic Modelling of Subcellular Biochemical Systems |
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contributing persons: |
Mukhtar Ullah[VerfasserIn] |
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13863811X |
Olaf Wolkenhauer
, Prof.[AkademischeR BetreuerIn] |
Hanspeter Herzel
, Prof.[AkademischeR BetreuerIn] |
Volkmar Liebscher
, Prof.[AkademischeR BetreuerIn] |
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contributing corporate bodies: |
Universität Rostock, Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät[Grad-verleihende Institution] |
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2147083-2 |
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abstract: |
Stochastic approaches are needed for modelling many cellular processes to capture
noise effects. The difficulty of solving the chemical master equation, the most common
formulation of stochastic models, is circumvented by stochastic simulations and analytical
approximations. The central theme here is one such approximation, the two-moment
approximation (2MA) which represents the mean-covariance coupling. Our 2MA formulation
allows non-elementary reactions and relative concentrations. The approach is applied
to the fission yeast cell cycle model. The analytical model reproduces the relevant
experimental data.
[English] |
Die Modellierung zellulärer Prozesse erfordert oft die Anwendung von stochastischen
Methoden. Das Problem, die master equation für biochemische Systeme zu lösen kann
auf zweierlei Weise umgangen werden. Entweder durch stochastische Simulationen oder
durch analytische Approximation. Das Herzstück hier ist die Entwicklung einer solchen
Approximation, der zwei-Momenten Approximation, welcher die Verknüpfung von Mittelwert
und Kovarianz repräsentiert und es erlaubt Modelle mit nicht elementaren Reaktionen
sowie relativen Konzentrationen zu analysieren. Dieser neue Ansatz , angewandt auf
ein anerkanntes Modell des Zellzyklus in der Bäckerhefe, reproduziert vorhandene experimentell
Daten.
[German] |
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document type: |
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institution: |
Faculty of Mathematics and Natural Sciences |
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language: |
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subject class (DDC): |
510 Mathematics |
570 Life science |
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publication / production: |
Rostock
Rostock: Universität Rostock
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2009
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identifiers: |
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access condition: |
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license/rights statement: |
all rights reserved This work may only be used under the terms of the German Copyright Law (Urheberrechtsgesetz). |
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RosDok id: |
rosdok_disshab_0000000272 |
created / modified: |
15.07.2009 / 08.08.2023
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metadata license: |
The metadata of this document was dedicated to the public domain (CC0 1.0 Universal Public Domain Dedication). |