title: |
Annotation-based storage and retrieval of models and simulation descriptions in computational
biology |
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contributing persons: |
Dagmar Waltemath[VerfasserIn] |
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1016855753 |
Andreas Heuer
, Prof. Dr. rer. nat. habil.[AkademischeR BetreuerIn] |
Nicolas Le Novère
, Dr.[AkademischeR BetreuerIn] |
Ulf Leser
, Prof. Dr.[AkademischeR BetreuerIn] |
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contributing corporate bodies: |
Universität Rostock, Fakultät für Informatik und Elektrotechnik[Grad-verleihende Institution] |
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10085032-7 |
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abstract: |
This work aimed at enhancing reuse of computational biology models by identifying
and formalizing relevant meta-information. One type of meta-information investigated
in this thesis is experiment-related meta-information attached to a model, which is
necessary to accurately recreate simulations. The main results are: a detailed concept
for model annotation, a proposed format for the encoding of simulation experiment
setups, a storage solution for standardized model representations and the development
of a retrieval concept.
[English] |
Die vorliegende Arbeit widmete sich der besseren Wiederverwendung biologischer Simulationsmodelle.
Ziele waren die Identifikation und Formalisierung relevanter Modell-Meta-Informationen,
sowie die Entwicklung geeigneter Modellspeicherungs- und Modellretrieval-Konzepte.
Wichtigste Ergebnisse der Arbeit sind ein detailliertes Modellannotationskonzept,
ein Formatvorschlag für standardisierte Kodierung von Simulationsexperimenten in XML,
eine Speicherlösung für Modellrepräsentationen sowie ein Retrieval-Konzept.
[German] |
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document type: |
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institution: |
Faculty of Computer Science and Electrical Engineering |
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language: |
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subject class (DDC): |
000 Generalities, Science |
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publication / production: |
Rostock
Rostock: Universität Rostock
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2011
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identifiers: |
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access condition: |
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license/rights statement: |
all rights reserved This work may only be used under the terms of the German Copyright Law (Urheberrechtsgesetz). |
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RosDok id: |
rosdok_disshab_0000000707 |
created / modified: |
09.11.2011 / 08.08.2023
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metadata license: |
The metadata of this document was dedicated to the public domain (CC0 1.0 Universal Public Domain Dedication). |