| title: |
| Investigating possibilities to predict milk phenotypes in Holstein Friesian cows based
on a more complex model of the genotype-phenotype map |
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| other title: |
| Untersuchung von Möglichkeiten zur Vorhersage von Milchmerkmalen von Holstein Friesian
Kühen basierend auf einem komplexeren Modell der Genotyp-Phänotyp-Abbildung
[translated]
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| contributing persons: |
| Nina Melzer[VerfasserIn] |
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1062851285 |
| Olaf Wolkenhauer
, Prof. Dr.[AkademischeR BetreuerIn] |
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133515931 |
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Universität Rostock, Lehrstuhl für Systembiologie und Bioinformatik, Institut für
Informatik und Elektrotechnik |
| Dirk Repsilber
, Dr.[AkademischeR BetreuerIn] |
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Leibniz-Institut für Nutztierbiologie, Institut für Genetik und Biometrie, Abteilung
Bioinformatik und Biomathematik |
| Thomas Martinetz
, Prof. Dr.[AkademischeR BetreuerIn] |
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Universität zu Lübeck, Sektion Informatik / Technik, Institut für Neuro- und Bioinformatik |
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| contributing corporate bodies: |
| Universität Rostock, Fakultät für Informatik und Elektrotechnik[Grad-verleihende Institution] |
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10085032-7 |
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| abstract: |
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The prediction of genetic values based on genomic and phenotypic information plays
an important role in dairy cattle breeding. This thesis investigates if an improved
prediction can be obtained when in addition the metabolome is considered. Data for
the three system-levels were (a) simulated using a systems biology approach and (b)
experimentally collected (~1300 cows). An integrative bioinformatics approach for
data analysis was developed. Concluding, the metabolome provides a deeper insight
into the relationships between different levels, whose exploitation can lead to improved
prediction.
[English] |
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In der Rinderzucht ist die Vorhersage von genetischen Werten beruhend auf Genotyp-
und Phänotypinformationen von zentraler Bedeutung. Die Arbeit untersucht, ob diese
verbessert werden kann, wenn zusätzlich das Metabolom betrachtet wird. Die Daten der
drei Ebenen wurden (a) mittels systembiologischen Ansatzes simuliert und (b) experimentell
(~1300 Kühe) erhoben. Für die Datenauswertung wurde ein integrativ bioinformatischer
Ansatz entwickelt. Das Metabolom erlaubt tiefergehende Untersuchungen der Beziehung
zwischen den Ebenen, deren Nutzung wiederum zu einer verbesserten Vorhersage führen
kann.
[German] |
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| document type: |
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| institution: |
| Faculty of Computer Science and Electrical Engineering |
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| language: |
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| subject class (DDC): |
| 000 Generalities, Science |
| 570 Life science |
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publication /
production: |
Rostock
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Rostock: Universität Rostock
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2014
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| identifiers: |
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| access condition: |
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| license/rights statement: |
all rights reserved
This work may only be used under the terms of the German Copyright Law (Urheberrechtsgesetz). |
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| RosDok id: |
rosdok_disshab_0000001264 |
| created / modified: |
28.11.2014 / 08.08.2023
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| metadata license: |
The metadata of this document was dedicated to the public domain
(CC0 1.0 Universal Public Domain Dedication). |
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