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| Customized workflow development and omics data integration concepts in systems medicine |
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| contributing persons: |
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| contributing corporate bodies: |
| Universität Rostock[Grad-verleihende Institution] |
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38329-6 |
| Universität Rostock, Fakultät für Informatik und Elektrotechnik[Grad-verleihende Institution] |
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10085032-7 |
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| abstract: |
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The ever-increasing amount and diversity of biological and medical data is a major
challenge in computational analyses. Computational methods have to be combined into
analysis workflows for seamless, swift, and transparent computation. In this work,
numerous workflows were developed for the general processing of bulk RNA sequencing
(RNA-Seq), single-cell sequencing experiments, and non-coding RNA identification.
Mathematical concepts of machine learning and univariate meta-analyses were successfully
implemented to independently investigate the role of cell therapies in cardiac regeneration.
[English] |
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Die wachsende Menge und Vielfalt biologischer und medizinischer Daten ist eine große
Herausforderung in Computeranalysen. Berechnungsmethoden müssen für eine schnelle
und transparente Berechnung zu Workflows kombiniert werden. In dieser Arbeit wurden
Workflows für die allgemeine Verarbeitung von RNA-Sequenzierung (RNA-Seq) sowie Einzelzell
RNA-Seq und die nichtkodierende RNA-Identifizierung entwickelt. Mathematische Konzepte
des maschinellen Lernens und univariate Metaanalysen wurden erfolgreich implementiert,
um die Rolle von Zelltherapien bei der Herzregeneration zu untersuchen.
[German] |
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| document type: |
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| institution: |
| Faculty of Computer Science and Electrical Engineering |
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| language: |
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| subject class (DDC): |
| 004 Data processing Computer sciences |
| 570 Life science |
| 610 Medical sciences Medicine |
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publication /
production: |
Rostock
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Rostock: Universität Rostock
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2020
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| statement of responsibility: |
| vorgelegt von Markus Wolfien |
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| notes: |
| Enthält Zeitschriftenbeiträge |
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| identifiers: |
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| access condition: |
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| license/rights statement: |
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| RosDok id: |
rosdok_disshab_0000002406 |
| created / modified: |
21.12.2020 / 08.08.2023
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| metadata license: |
The metadata of this document was dedicated to the public domain
(CC0 1.0 Universal Public Domain Dedication). |
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