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| Etablierung des E2F1-Interaktoms metastasierungsrelevanter Faktoren durch Integration
bioinformatischer und experimenteller Methoden |
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| contributing persons: |
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| contributing corporate bodies: |
| Universität Rostock[Grad-verleihende Institution] |
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38329-6 |
| Universität Rostock, Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät[Grad-verleihende Institution] |
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2147083-2 |
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| abstract: |
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In dieser Arbeit wurde durch intensive Literatur- und Datenbankrecherche ein Protein-Protein/Gen-Interaktionsnetzwerk
um den Transkriptionsfaktor E2F1 herum erstellt. Er ist Schlüsselfaktor für die epithelial-mesenchymale
Transition (EMT), Voraussetzung für die Metastasierung. Eine anschließende bioinformatische
Analyse identifizierte tumorspezifische Signaturen der E2F1-vermittelten EMT, welche
experimentell und anhand von Patientendaten validiert wurden. Gemeinsame Zielgene
des näher untersuchten E2F1-TGFβ-Interaktoms bieten mögliche Therapieziele für Krebspatienten.
[German] |
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By intensive literature and database research we constructed a comprehensive map of
interactions around the transcription factor E2F1, a key driver of the epithelial-mesenchymal
transition (EMT) as a prerequisite for metastasis. The subsequent bioinformatics analysis
of this map lead to the identification of tumour-specific molecular signatures of
E2F1-driven EMT. These signatures were validated experimentally as well as on patient
data. Common transcriptional targets of the investigated E2F1-TGFβ co-regulome might
be suitable therapeutic targets for cancer patients.
[English] |
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| document type: |
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| institution: |
| Faculty of Mathematics and Natural Sciences |
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| language: |
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| subject class (DDC): |
| 570 Life science |
| 610 Medical sciences Medicine |
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publication /
production: |
Rostock
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Rostock: Universität Rostock
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2019
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| statement of responsibility: |
| vorgelegt von Stephan Marquardt |
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| notes: |
| Für nähere Informationen zur bioinformatischen Analyse des E2F1-Netzwerkes, siehe
die parallele Doktorarbeit von Faiz M. Khan: "An integrated workflow to study large-scale
biochemical networks" der Fakultät für Informatik und Elektrotechnik der Universität
Rostock. Teile beider Doktorarbeiten wurden publiziert unter: "Unraveling a tumor
type-specific regulatory core underlying E2F1-mediated epithelial-mesenchymal transition
to predict receptor protein signatures" Khan FM, Marquardt S, Gupta SK, Knoll S, Schmitz
U, Spitschak A, Engelmann D, Vera J, Wolkenhauer O, Pützer BM. Nat Commun. 2017 Aug
4;8(1):198. doi: 10.1038/s41467-017-00268-2. |
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| identifiers: |
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| access condition: |
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| license/rights statement: |
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| RosDok id: |
rosdok_disshab_0000002498 |
| created / modified: |
26.04.2021 / 08.08.2023
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| metadata license: |
The metadata of this document was dedicated to the public domain
(CC0 1.0 Universal Public Domain Dedication). |
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