Development and application of affinity-mass spectrometry to identify protein-carbohydrate interactions

Yannick Baschung

doi:10.18453/rosdok_id00004147

Yannick Baschung

Development and application of affinity-mass spectrometry to identify protein-carbohydrate interactions

Universität Rostock, 2022

https://doi.org/10.18453/rosdok_id00004147

Abstract: Die druckunterstützte proteolytische Exzision, kombiniert mit MALDI und ESI-MS, wurde zur Identifizierung der Epitop-Bindungsstellen von GalNac und Blutgruppen-Oligosacchariden in Lektinen eingesetzt. Die identifizierten Epitoppeptide umfassen alle wesentlichen Aminosäuren, die an der Kohlenhydraterkennung beteiligt sind, und stimmen vollständig mit den verfügbaren Röntgenstrukturen überein. Die Kopplung einer spezifischen Peptid-Glykoprobe an die Goldoberfläche eines Biosensorchips wurde erfolgreich für die Identifizierung von Kohlenhydrat-Epitopen und Affinitätsmessungen eingesetzt.

Dissertation Freier Zugang

title:

Development and application of affinity-mass spectrometry to identify protein-carbohydrate interactions

contributing persons:

Yannick Baschung[VerfasserIn]
	0000-0003-2717-7706
	1280533463
Michael Glocker[AkademischeR BetreuerIn]
	0000-0001-9190-482X
	1014052165
Michael Pryzbylski[AkademischeR BetreuerIn]
	Steinbeis Center for Biopolymer Analysis and Biomedical Mass Spectrometry
Christopher Gerner[AkademischeR BetreuerIn]
	Universität Wien

contributing corporate bodies:

Universität Rostock[Grad-verleihende Institution]
	38329-6
Universitätsmedizin Rostock[Grad-verleihende Institution]
	1029510660

abstract:

Affinity mass spectrometry using selective and pressure-enhanced proteolytic excision and extraction combined with MALDI and ESI-MS has been applied to the identification of epitope binding sites of GalNac and blood group oligosaccharides in lectins. The epitope peptides identified comprise all essential amino acids involved in carbohydrate recognition, in complete agreement with available X-ray structures. Coupling of a specific peptide glycoprobe to the gold surface of a biosensor chip was successfully employed for identification of carbohydrate epitopes and affinity measurements. [Englisch]

Die druckunterstützte proteolytische Exzision, kombiniert mit MALDI und ESI-MS, wurde zur Identifizierung der Epitop-Bindungsstellen von GalNac und Blutgruppen-Oligosacchariden in Lektinen eingesetzt. Die identifizierten Epitoppeptide umfassen alle wesentlichen Aminosäuren, die an der Kohlenhydraterkennung beteiligt sind, und stimmen vollständig mit den verfügbaren Röntgenstrukturen überein. Die Kopplung einer spezifischen Peptid-Glykoprobe an die Goldoberfläche eines Biosensorchips wurde erfolgreich für die Identifizierung von Kohlenhydrat-Epitopen und Affinitätsmessungen eingesetzt. [Deutsch]

document type:

Dissertation

institution:

Universitätsmedizin

language:

Englisch

Deutsch

subject class (DDC):

540 Chemie

610 Medizin, Gesundheit

publication /
production:

Rostock: Universität Rostock