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| Contributions to the reuse and reproducibility of computational biology models |
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| contributing persons: |
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| contributing corporate bodies: |
| Universität Rostock[Grad-verleihende Institution] |
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38329-6 |
| Universität Rostock, Fakultät für Informatik und Elektrotechnik[Grad-verleihende Institution] |
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10085032-7 |
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| abstract: |
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Diese Arbeit befasst sich mit der Reproduzierbarkeit und Wiederverwendbarkeit von
systembiologischen Modellen, wobei die FAIR-Prinzipien (findable, accessible, interoperable,
reusable) im Vordergrund stehen. Sie konzentriert sich auf 5 zentrale Forschungsfragen:
Schaffung einer Grundlage für die Modellverwaltung, Auffinden heterogener, halbstrukturierter
Modelldaten, Nachverfolgung der Modellentwicklung im Laufe der Zeit, Speicherung von
Modellen und ihren Metadaten, Definition der wichtigsten Modellkomponenten für die
Ähnlichkeitsanalyse.
[German] |
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This thesis addresses systems biology model reproducibility and reusability, emphasizing
FAIR (findable, accessible, interoperable, reusable) principles. It focuses on 5 core
research queries: establishing a baseline for model management, retrieving and ranking
heterogeneous, semi-structured model data, tracing model evolution over time, storing
models and their metadata, defining crucial model components for similarity analysis.
[English] |
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| document type: |
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| institution: |
| Faculty of Computer Science and Electrical Engineering |
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| language: |
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| subject class (DDC): |
| 004 Data processing Computer sciences |
| 570 Life science |
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publication / production: |
Rostock
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Rostock: Universität Rostock
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2022
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| statement of responsibility: |
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| identifiers: |
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| access condition: |
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| license/rights statement: |
all rights reserved This work may only be used under the terms of the German Copyright Law (Urheberrechtsgesetz). |
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| RosDok id: |
rosdok_disshab_0000003034 |
| created / modified: |
28.08.2023 / 29.08.2023
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| metadata license: |
The metadata of this document was dedicated to the public domain (CC0 1.0 Universal Public Domain Dedication). |