Titel: |
Stochastic Modelling of Subcellular Biochemical Systems |
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Beteiligte Personen: |
Mukhtar Ullah[VerfasserIn] |
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13863811X |
Olaf Wolkenhauer
, Prof.[AkademischeR BetreuerIn] |
Hanspeter Herzel
, Prof.[AkademischeR BetreuerIn] |
Volkmar Liebscher
, Prof.[AkademischeR BetreuerIn] |
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Beteiligte Körperschaften: |
Universität Rostock, Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät[Grad-verleihende Institution] |
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2147083-2 |
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Zusammenfassung: |
Stochastic approaches are needed for modelling many cellular processes to capture
noise effects. The difficulty of solving the chemical master equation, the most common
formulation of stochastic models, is circumvented by stochastic simulations and analytical
approximations. The central theme here is one such approximation, the two-moment
approximation (2MA) which represents the mean-covariance coupling. Our 2MA formulation
allows non-elementary reactions and relative concentrations. The approach is applied
to the fission yeast cell cycle model. The analytical model reproduces the relevant
experimental data.
[Englisch] |
Die Modellierung zellulärer Prozesse erfordert oft die Anwendung von stochastischen
Methoden. Das Problem, die master equation für biochemische Systeme zu lösen kann
auf zweierlei Weise umgangen werden. Entweder durch stochastische Simulationen oder
durch analytische Approximation. Das Herzstück hier ist die Entwicklung einer solchen
Approximation, der zwei-Momenten Approximation, welcher die Verknüpfung von Mittelwert
und Kovarianz repräsentiert und es erlaubt Modelle mit nicht elementaren Reaktionen
sowie relativen Konzentrationen zu analysieren. Dieser neue Ansatz , angewandt auf
ein anerkanntes Modell des Zellzyklus in der Bäckerhefe, reproduziert vorhandene experimentell
Daten.
[Deutsch] |
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Dokumenttyp: |
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Einrichtung: |
Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät |
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Sprache: |
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Sachgruppe der DNB: |
510 Mathematik |
570 Biowissenschaften, Biologie |
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Veröffentlichung / Entstehung: |
Rostock
Rostock: Universität Rostock
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2009
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Identifikatoren: |
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Zugang: |
frei zugänglich (Open Access)
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Lizenz/Rechtehinweis: |
alle Rechte vorbehalten Das Werk darf ausschließlich nach den vom deutschen Urheberrechtsgesetz festgelegten Bedingungen genutzt werden. |
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RosDok-ID: |
rosdok_disshab_0000000272 |
erstellt / geändert am: |
15.07.2009 / 08.08.2023
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Metadaten-Lizenz: |
Die Metadaten zu diesem Dokument sind gemeinfrei (CC0 1.0 Universal Public Domain Dedication). |